Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHB9

SRP68, Signal recognition particle subunit SRP68, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP68Q9UHB9 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
SRP68Q9UHB9 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SRP68Q9UHB9 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SRP68Q9UHB9 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
SRP68Q9UHB9 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SRP68Q9UHB9 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SRP68Q9UHB9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SRP68Q9UHB9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
SRP68Q9UHB9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SRP68Q9UHB9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SRP68Q9UHB9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SRP68Q9UHB9 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SRP68Q9UHB9 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SRP68Q9UHB9 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SRP68Q9UHB9 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SRP68Q9UHB9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SRP68Q9UHB9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SRP68Q9UHB9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SRP68Q9UHB9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SRP68Q9UHB9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SRP68Q9UHB9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SRP68Q9UHB9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SRP68Q9UHB9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SRP68Q9UHB9 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SRP68Q9UHB9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SRP68Q9UHB9 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SRP68Q9UHB9 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SRP68Q9UHB9 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SRP68Q9UHB9 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SRP68Q9UHB9 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SRP68Q9UHB9 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SRP68Q9UHB9 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SRP68Q9UHB9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SRP68Q9UHB9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SRP68Q9UHB9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
SRP68Q9UHB9 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SRP68Q9UHB9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SRP68Q9UHB9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SRP68Q9UHB9 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SRP68Q9UHB9 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
SRP68Q9UHB9 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SRP68Q9UHB9 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SRP68Q9UHB9 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SRP68Q9UHB9 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
SRP68Q9UHB9 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
SRP68Q9UHB9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SRP68Q9UHB9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SRP68Q9UHB9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SRP68Q9UHB9 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SRP68Q9UHB9 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
SRP68Q9UHB9 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SRP68Q9UHB9 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
SRP68Q9UHB9 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC28■■■□□ 2.07
SRP68Q9UHB9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SRP68Q9UHB9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SRP68Q9UHB9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SRP68Q9UHB9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SRP68Q9UHB9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SRP68Q9UHB9 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SRP68Q9UHB9 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SRP68Q9UHB9 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SRP68Q9UHB9 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SRP68Q9UHB9 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SRP68Q9UHB9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SRP68Q9UHB9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SRP68Q9UHB9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SRP68Q9UHB9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SRP68Q9UHB9 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SRP68Q9UHB9 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SRP68Q9UHB9 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SRP68Q9UHB9 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SRP68Q9UHB9 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SRP68Q9UHB9 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
SRP68Q9UHB9 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SRP68Q9UHB9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SRP68Q9UHB9 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SRP68Q9UHB9 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SRP68Q9UHB9 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SRP68Q9UHB9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SRP68Q9UHB9 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
SRP68Q9UHB9 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SRP68Q9UHB9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SRP68Q9UHB9 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SRP68Q9UHB9 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
SRP68Q9UHB9 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SRP68Q9UHB9 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SRP68Q9UHB9 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SRP68Q9UHB9 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SRP68Q9UHB9 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SRP68Q9UHB9 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SRP68Q9UHB9 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SRP68Q9UHB9 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SRP68Q9UHB9 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SRP68Q9UHB9 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SRP68Q9UHB9 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SRP68Q9UHB9 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SRP68Q9UHB9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SRP68Q9UHB9 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SRP68Q9UHB9 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SRP68Q9UHB9 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms