Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVZ3

NECAP2, Adaptin ear-binding coat-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECAP2Q9NVZ3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NECAP2Q9NVZ3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NECAP2Q9NVZ3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
NECAP2Q9NVZ3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
NECAP2Q9NVZ3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NECAP2Q9NVZ3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NECAP2Q9NVZ3 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NECAP2Q9NVZ3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NECAP2Q9NVZ3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NECAP2Q9NVZ3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NECAP2Q9NVZ3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NECAP2Q9NVZ3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
NECAP2Q9NVZ3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
NECAP2Q9NVZ3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
NECAP2Q9NVZ3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NECAP2Q9NVZ3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NECAP2Q9NVZ3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NECAP2Q9NVZ3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NECAP2Q9NVZ3 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NECAP2Q9NVZ3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NECAP2Q9NVZ3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NECAP2Q9NVZ3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NECAP2Q9NVZ3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NECAP2Q9NVZ3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NECAP2Q9NVZ3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NECAP2Q9NVZ3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NECAP2Q9NVZ3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NECAP2Q9NVZ3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NECAP2Q9NVZ3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NECAP2Q9NVZ3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NECAP2Q9NVZ3 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NECAP2Q9NVZ3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NECAP2Q9NVZ3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NECAP2Q9NVZ3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NECAP2Q9NVZ3 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NECAP2Q9NVZ3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NECAP2Q9NVZ3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NECAP2Q9NVZ3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NECAP2Q9NVZ3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NECAP2Q9NVZ3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NECAP2Q9NVZ3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NECAP2Q9NVZ3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NECAP2Q9NVZ3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NECAP2Q9NVZ3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NECAP2Q9NVZ3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NECAP2Q9NVZ3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NECAP2Q9NVZ3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NECAP2Q9NVZ3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NECAP2Q9NVZ3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NECAP2Q9NVZ3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NECAP2Q9NVZ3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NECAP2Q9NVZ3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
NECAP2Q9NVZ3 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NECAP2Q9NVZ3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NECAP2Q9NVZ3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NECAP2Q9NVZ3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NECAP2Q9NVZ3 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NECAP2Q9NVZ3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NECAP2Q9NVZ3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NECAP2Q9NVZ3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NECAP2Q9NVZ3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NECAP2Q9NVZ3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NECAP2Q9NVZ3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NECAP2Q9NVZ3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NECAP2Q9NVZ3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NECAP2Q9NVZ3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NECAP2Q9NVZ3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NECAP2Q9NVZ3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NECAP2Q9NVZ3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NECAP2Q9NVZ3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NECAP2Q9NVZ3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NECAP2Q9NVZ3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NECAP2Q9NVZ3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NECAP2Q9NVZ3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NECAP2Q9NVZ3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NECAP2Q9NVZ3 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NECAP2Q9NVZ3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NECAP2Q9NVZ3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NECAP2Q9NVZ3 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NECAP2Q9NVZ3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NECAP2Q9NVZ3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NECAP2Q9NVZ3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NECAP2Q9NVZ3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NECAP2Q9NVZ3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
NECAP2Q9NVZ3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NECAP2Q9NVZ3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NECAP2Q9NVZ3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NECAP2Q9NVZ3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NECAP2Q9NVZ3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NECAP2Q9NVZ3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NECAP2Q9NVZ3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NECAP2Q9NVZ3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NECAP2Q9NVZ3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NECAP2Q9NVZ3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NECAP2Q9NVZ3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NECAP2Q9NVZ3 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NECAP2Q9NVZ3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NECAP2Q9NVZ3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NECAP2Q9NVZ3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NECAP2Q9NVZ3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms