Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX6

TMEM167B, Protein kish-B, humanhuman

Predictions only

Length 74 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM167BQ9NRX6 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM167BQ9NRX6 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM167BQ9NRX6 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM167BQ9NRX6 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM167BQ9NRX6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM167BQ9NRX6 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM167BQ9NRX6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM167BQ9NRX6 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM167BQ9NRX6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM167BQ9NRX6 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM167BQ9NRX6 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
TMEM167BQ9NRX6 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
TMEM167BQ9NRX6 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
TMEM167BQ9NRX6 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM167BQ9NRX6 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM167BQ9NRX6 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM167BQ9NRX6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM167BQ9NRX6 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM167BQ9NRX6 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM167BQ9NRX6 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM167BQ9NRX6 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM167BQ9NRX6 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM167BQ9NRX6 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM167BQ9NRX6 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM167BQ9NRX6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM167BQ9NRX6 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM167BQ9NRX6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM167BQ9NRX6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM167BQ9NRX6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM167BQ9NRX6 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM167BQ9NRX6 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM167BQ9NRX6 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM167BQ9NRX6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM167BQ9NRX6 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM167BQ9NRX6 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM167BQ9NRX6 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM167BQ9NRX6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM167BQ9NRX6 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM167BQ9NRX6 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM167BQ9NRX6 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM167BQ9NRX6 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM167BQ9NRX6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM167BQ9NRX6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM167BQ9NRX6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM167BQ9NRX6 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM167BQ9NRX6 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM167BQ9NRX6 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM167BQ9NRX6 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM167BQ9NRX6 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM167BQ9NRX6 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM167BQ9NRX6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM167BQ9NRX6 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM167BQ9NRX6 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM167BQ9NRX6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMEM167BQ9NRX6 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM167BQ9NRX6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM167BQ9NRX6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM167BQ9NRX6 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM167BQ9NRX6 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM167BQ9NRX6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM167BQ9NRX6 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM167BQ9NRX6 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM167BQ9NRX6 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM167BQ9NRX6 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM167BQ9NRX6 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM167BQ9NRX6 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMEM167BQ9NRX6 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM167BQ9NRX6 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM167BQ9NRX6 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM167BQ9NRX6 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM167BQ9NRX6 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM167BQ9NRX6 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM167BQ9NRX6 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM167BQ9NRX6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM167BQ9NRX6 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM167BQ9NRX6 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM167BQ9NRX6 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM167BQ9NRX6 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM167BQ9NRX6 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM167BQ9NRX6 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMEM167BQ9NRX6 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM167BQ9NRX6 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM167BQ9NRX6 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM167BQ9NRX6 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM167BQ9NRX6 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM167BQ9NRX6 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM167BQ9NRX6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM167BQ9NRX6 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM167BQ9NRX6 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM167BQ9NRX6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM167BQ9NRX6 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM167BQ9NRX6 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM167BQ9NRX6 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMEM167BQ9NRX6 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TMEM167BQ9NRX6 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TMEM167BQ9NRX6 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TMEM167BQ9NRX6 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TMEM167BQ9NRX6 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TMEM167BQ9NRX6 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TMEM167BQ9NRX6 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms