Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZCCHC17Q9NP64 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZCCHC17Q9NP64 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
ZCCHC17Q9NP64 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ZCCHC17Q9NP64 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
ZCCHC17Q9NP64 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
ZCCHC17Q9NP64 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
ZCCHC17Q9NP64 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ZCCHC17Q9NP64 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZCCHC17Q9NP64 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZCCHC17Q9NP64 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
ZCCHC17Q9NP64 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZCCHC17Q9NP64 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZCCHC17Q9NP64 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZCCHC17Q9NP64 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZCCHC17Q9NP64 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZCCHC17Q9NP64 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZCCHC17Q9NP64 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZCCHC17Q9NP64 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZCCHC17Q9NP64 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZCCHC17Q9NP64 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZCCHC17Q9NP64 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZCCHC17Q9NP64 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZCCHC17Q9NP64 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZCCHC17Q9NP64 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZCCHC17Q9NP64 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZCCHC17Q9NP64 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZCCHC17Q9NP64 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZCCHC17Q9NP64 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ZCCHC17Q9NP64 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZCCHC17Q9NP64 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZCCHC17Q9NP64 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZCCHC17Q9NP64 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZCCHC17Q9NP64 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZCCHC17Q9NP64 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZCCHC17Q9NP64 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZCCHC17Q9NP64 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZCCHC17Q9NP64 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZCCHC17Q9NP64 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZCCHC17Q9NP64 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZCCHC17Q9NP64 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZCCHC17Q9NP64 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
ZCCHC17Q9NP64 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZCCHC17Q9NP64 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZCCHC17Q9NP64 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZCCHC17Q9NP64 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZCCHC17Q9NP64 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZCCHC17Q9NP64 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZCCHC17Q9NP64 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZCCHC17Q9NP64 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ZCCHC17Q9NP64 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZCCHC17Q9NP64 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZCCHC17Q9NP64 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZCCHC17Q9NP64 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZCCHC17Q9NP64 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZCCHC17Q9NP64 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZCCHC17Q9NP64 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZCCHC17Q9NP64 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZCCHC17Q9NP64 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZCCHC17Q9NP64 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZCCHC17Q9NP64 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZCCHC17Q9NP64 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZCCHC17Q9NP64 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZCCHC17Q9NP64 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZCCHC17Q9NP64 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZCCHC17Q9NP64 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZCCHC17Q9NP64 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZCCHC17Q9NP64 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZCCHC17Q9NP64 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZCCHC17Q9NP64 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZCCHC17Q9NP64 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZCCHC17Q9NP64 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZCCHC17Q9NP64 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZCCHC17Q9NP64 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
ZCCHC17Q9NP64 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZCCHC17Q9NP64 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZCCHC17Q9NP64 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZCCHC17Q9NP64 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZCCHC17Q9NP64 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZCCHC17Q9NP64 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZCCHC17Q9NP64 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
ZCCHC17Q9NP64 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
ZCCHC17Q9NP64 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZCCHC17Q9NP64 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZCCHC17Q9NP64 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZCCHC17Q9NP64 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZCCHC17Q9NP64 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZCCHC17Q9NP64 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZCCHC17Q9NP64 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZCCHC17Q9NP64 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZCCHC17Q9NP64 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZCCHC17Q9NP64 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZCCHC17Q9NP64 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZCCHC17Q9NP64 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZCCHC17Q9NP64 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZCCHC17Q9NP64 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZCCHC17Q9NP64 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZCCHC17Q9NP64 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZCCHC17Q9NP64 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZCCHC17Q9NP64 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms