Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP55

BPIFA1, BPI fold-containing family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA1Q9NP55 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BPIFA1Q9NP55 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BPIFA1Q9NP55 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BPIFA1Q9NP55 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BPIFA1Q9NP55 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BPIFA1Q9NP55 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BPIFA1Q9NP55 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BPIFA1Q9NP55 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BPIFA1Q9NP55 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BPIFA1Q9NP55 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BPIFA1Q9NP55 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BPIFA1Q9NP55 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BPIFA1Q9NP55 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BPIFA1Q9NP55 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BPIFA1Q9NP55 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BPIFA1Q9NP55 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BPIFA1Q9NP55 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BPIFA1Q9NP55 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BPIFA1Q9NP55 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
BPIFA1Q9NP55 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
BPIFA1Q9NP55 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BPIFA1Q9NP55 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BPIFA1Q9NP55 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BPIFA1Q9NP55 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BPIFA1Q9NP55 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BPIFA1Q9NP55 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BPIFA1Q9NP55 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BPIFA1Q9NP55 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BPIFA1Q9NP55 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BPIFA1Q9NP55 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BPIFA1Q9NP55 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BPIFA1Q9NP55 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BPIFA1Q9NP55 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
BPIFA1Q9NP55 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BPIFA1Q9NP55 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BPIFA1Q9NP55 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BPIFA1Q9NP55 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BPIFA1Q9NP55 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BPIFA1Q9NP55 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BPIFA1Q9NP55 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BPIFA1Q9NP55 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BPIFA1Q9NP55 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BPIFA1Q9NP55 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BPIFA1Q9NP55 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BPIFA1Q9NP55 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BPIFA1Q9NP55 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BPIFA1Q9NP55 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
BPIFA1Q9NP55 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BPIFA1Q9NP55 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BPIFA1Q9NP55 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BPIFA1Q9NP55 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BPIFA1Q9NP55 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BPIFA1Q9NP55 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BPIFA1Q9NP55 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BPIFA1Q9NP55 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BPIFA1Q9NP55 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BPIFA1Q9NP55 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BPIFA1Q9NP55 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BPIFA1Q9NP55 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BPIFA1Q9NP55 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BPIFA1Q9NP55 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BPIFA1Q9NP55 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BPIFA1Q9NP55 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BPIFA1Q9NP55 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BPIFA1Q9NP55 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BPIFA1Q9NP55 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BPIFA1Q9NP55 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BPIFA1Q9NP55 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
BPIFA1Q9NP55 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BPIFA1Q9NP55 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BPIFA1Q9NP55 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BPIFA1Q9NP55 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BPIFA1Q9NP55 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BPIFA1Q9NP55 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BPIFA1Q9NP55 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BPIFA1Q9NP55 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BPIFA1Q9NP55 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
BPIFA1Q9NP55 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BPIFA1Q9NP55 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BPIFA1Q9NP55 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BPIFA1Q9NP55 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BPIFA1Q9NP55 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BPIFA1Q9NP55 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BPIFA1Q9NP55 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BPIFA1Q9NP55 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BPIFA1Q9NP55 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BPIFA1Q9NP55 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BPIFA1Q9NP55 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BPIFA1Q9NP55 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BPIFA1Q9NP55 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BPIFA1Q9NP55 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
BPIFA1Q9NP55 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BPIFA1Q9NP55 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
BPIFA1Q9NP55 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BPIFA1Q9NP55 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BPIFA1Q9NP55 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BPIFA1Q9NP55 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BPIFA1Q9NP55 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BPIFA1Q9NP55 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BPIFA1Q9NP55 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.5 ms