Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEMA3CQ99985 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEMA3CQ99985 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEMA3CQ99985 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEMA3CQ99985 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEMA3CQ99985 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEMA3CQ99985 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEMA3CQ99985 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEMA3CQ99985 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEMA3CQ99985 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEMA3CQ99985 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEMA3CQ99985 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEMA3CQ99985 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA3CQ99985 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA3CQ99985 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA3CQ99985 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA3CQ99985 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA3CQ99985 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA3CQ99985 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA3CQ99985 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA3CQ99985 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA3CQ99985 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA3CQ99985 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA3CQ99985 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA3CQ99985 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA3CQ99985 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA3CQ99985 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA3CQ99985 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA3CQ99985 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA3CQ99985 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA3CQ99985 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA3CQ99985 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA3CQ99985 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA3CQ99985 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA3CQ99985 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA3CQ99985 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA3CQ99985 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA3CQ99985 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA3CQ99985 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA3CQ99985 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA3CQ99985 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA3CQ99985 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA3CQ99985 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA3CQ99985 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA3CQ99985 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA3CQ99985 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA3CQ99985 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA3CQ99985 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA3CQ99985 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA3CQ99985 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA3CQ99985 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA3CQ99985 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA3CQ99985 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA3CQ99985 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA3CQ99985 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA3CQ99985 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMA3CQ99985 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMA3CQ99985 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMA3CQ99985 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMA3CQ99985 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMA3CQ99985 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMA3CQ99985 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMA3CQ99985 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA3CQ99985 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA3CQ99985 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA3CQ99985 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA3CQ99985 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA3CQ99985 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA3CQ99985 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA3CQ99985 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA3CQ99985 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA3CQ99985 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA3CQ99985 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA3CQ99985 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA3CQ99985 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA3CQ99985 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA3CQ99985 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA3CQ99985 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA3CQ99985 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEMA3CQ99985 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEMA3CQ99985 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEMA3CQ99985 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEMA3CQ99985 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEMA3CQ99985 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEMA3CQ99985 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEMA3CQ99985 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEMA3CQ99985 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEMA3CQ99985 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEMA3CQ99985 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA3CQ99985 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA3CQ99985 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA3CQ99985 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA3CQ99985 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA3CQ99985 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA3CQ99985 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA3CQ99985 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA3CQ99985 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA3CQ99985 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA3CQ99985 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA3CQ99985 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.6 ms