Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMIM12Q96EX1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMIM12Q96EX1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SMIM12Q96EX1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMIM12Q96EX1 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMIM12Q96EX1 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMIM12Q96EX1 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMIM12Q96EX1 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMIM12Q96EX1 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SMIM12Q96EX1 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMIM12Q96EX1 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMIM12Q96EX1 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SMIM12Q96EX1 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMIM12Q96EX1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMIM12Q96EX1 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMIM12Q96EX1 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMIM12Q96EX1 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMIM12Q96EX1 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMIM12Q96EX1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMIM12Q96EX1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SMIM12Q96EX1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMIM12Q96EX1 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMIM12Q96EX1 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMIM12Q96EX1 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMIM12Q96EX1 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMIM12Q96EX1 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMIM12Q96EX1 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMIM12Q96EX1 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMIM12Q96EX1 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMIM12Q96EX1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMIM12Q96EX1 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMIM12Q96EX1 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMIM12Q96EX1 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMIM12Q96EX1 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMIM12Q96EX1 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMIM12Q96EX1 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMIM12Q96EX1 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMIM12Q96EX1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMIM12Q96EX1 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMIM12Q96EX1 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMIM12Q96EX1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMIM12Q96EX1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMIM12Q96EX1 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMIM12Q96EX1 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMIM12Q96EX1 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMIM12Q96EX1 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMIM12Q96EX1 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMIM12Q96EX1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMIM12Q96EX1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SMIM12Q96EX1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMIM12Q96EX1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMIM12Q96EX1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMIM12Q96EX1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMIM12Q96EX1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMIM12Q96EX1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMIM12Q96EX1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SMIM12Q96EX1 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMIM12Q96EX1 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMIM12Q96EX1 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMIM12Q96EX1 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMIM12Q96EX1 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMIM12Q96EX1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMIM12Q96EX1 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMIM12Q96EX1 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMIM12Q96EX1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SMIM12Q96EX1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMIM12Q96EX1 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMIM12Q96EX1 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMIM12Q96EX1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMIM12Q96EX1 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMIM12Q96EX1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMIM12Q96EX1 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMIM12Q96EX1 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMIM12Q96EX1 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMIM12Q96EX1 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMIM12Q96EX1 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMIM12Q96EX1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMIM12Q96EX1 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMIM12Q96EX1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMIM12Q96EX1 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMIM12Q96EX1 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMIM12Q96EX1 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMIM12Q96EX1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMIM12Q96EX1 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMIM12Q96EX1 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMIM12Q96EX1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMIM12Q96EX1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMIM12Q96EX1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SMIM12Q96EX1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMIM12Q96EX1 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMIM12Q96EX1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMIM12Q96EX1 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMIM12Q96EX1 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMIM12Q96EX1 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMIM12Q96EX1 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMIM12Q96EX1 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMIM12Q96EX1 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMIM12Q96EX1 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMIM12Q96EX1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMIM12Q96EX1 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms