Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ3

TRIM43, Tripartite motif-containing protein 43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM43Q96BQ3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM43Q96BQ3 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM43Q96BQ3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM43Q96BQ3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM43Q96BQ3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM43Q96BQ3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM43Q96BQ3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM43Q96BQ3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM43Q96BQ3 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM43Q96BQ3 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM43Q96BQ3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM43Q96BQ3 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM43Q96BQ3 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM43Q96BQ3 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM43Q96BQ3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM43Q96BQ3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM43Q96BQ3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM43Q96BQ3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM43Q96BQ3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM43Q96BQ3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM43Q96BQ3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM43Q96BQ3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM43Q96BQ3 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM43Q96BQ3 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM43Q96BQ3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM43Q96BQ3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM43Q96BQ3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM43Q96BQ3 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM43Q96BQ3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM43Q96BQ3 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM43Q96BQ3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM43Q96BQ3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM43Q96BQ3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM43Q96BQ3 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM43Q96BQ3 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM43Q96BQ3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM43Q96BQ3 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM43Q96BQ3 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM43Q96BQ3 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM43Q96BQ3 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM43Q96BQ3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM43Q96BQ3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM43Q96BQ3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM43Q96BQ3 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM43Q96BQ3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM43Q96BQ3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM43Q96BQ3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM43Q96BQ3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM43Q96BQ3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM43Q96BQ3 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM43Q96BQ3 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM43Q96BQ3 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM43Q96BQ3 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM43Q96BQ3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM43Q96BQ3 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM43Q96BQ3 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM43Q96BQ3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM43Q96BQ3 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM43Q96BQ3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM43Q96BQ3 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM43Q96BQ3 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM43Q96BQ3 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM43Q96BQ3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM43Q96BQ3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM43Q96BQ3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM43Q96BQ3 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM43Q96BQ3 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM43Q96BQ3 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM43Q96BQ3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM43Q96BQ3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM43Q96BQ3 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM43Q96BQ3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM43Q96BQ3 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM43Q96BQ3 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM43Q96BQ3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM43Q96BQ3 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM43Q96BQ3 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM43Q96BQ3 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM43Q96BQ3 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM43Q96BQ3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM43Q96BQ3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM43Q96BQ3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM43Q96BQ3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM43Q96BQ3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM43Q96BQ3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM43Q96BQ3 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM43Q96BQ3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM43Q96BQ3 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM43Q96BQ3 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM43Q96BQ3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM43Q96BQ3 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM43Q96BQ3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM43Q96BQ3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM43Q96BQ3 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM43Q96BQ3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM43Q96BQ3 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM43Q96BQ3 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM43Q96BQ3 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM43Q96BQ3 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM43Q96BQ3 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms