Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8J0

PI4KAP1, Putative inactive phosphatidylinositol 4-kinase alpha-like protein P1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PI4KAP1Q8N8J0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PI4KAP1Q8N8J0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PI4KAP1Q8N8J0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PI4KAP1Q8N8J0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PI4KAP1Q8N8J0 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PI4KAP1Q8N8J0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PI4KAP1Q8N8J0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PI4KAP1Q8N8J0 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PI4KAP1Q8N8J0 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PI4KAP1Q8N8J0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PI4KAP1Q8N8J0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PI4KAP1Q8N8J0 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PI4KAP1Q8N8J0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PI4KAP1Q8N8J0 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PI4KAP1Q8N8J0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PI4KAP1Q8N8J0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PI4KAP1Q8N8J0 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PI4KAP1Q8N8J0 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PI4KAP1Q8N8J0 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PI4KAP1Q8N8J0 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PI4KAP1Q8N8J0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PI4KAP1Q8N8J0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PI4KAP1Q8N8J0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PI4KAP1Q8N8J0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PI4KAP1Q8N8J0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PI4KAP1Q8N8J0 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PI4KAP1Q8N8J0 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PI4KAP1Q8N8J0 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PI4KAP1Q8N8J0 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
PI4KAP1Q8N8J0 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PI4KAP1Q8N8J0 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PI4KAP1Q8N8J0 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PI4KAP1Q8N8J0 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PI4KAP1Q8N8J0 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PI4KAP1Q8N8J0 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PI4KAP1Q8N8J0 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PI4KAP1Q8N8J0 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PI4KAP1Q8N8J0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PI4KAP1Q8N8J0 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PI4KAP1Q8N8J0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PI4KAP1Q8N8J0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PI4KAP1Q8N8J0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PI4KAP1Q8N8J0 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PI4KAP1Q8N8J0 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PI4KAP1Q8N8J0 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PI4KAP1Q8N8J0 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PI4KAP1Q8N8J0 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PI4KAP1Q8N8J0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PI4KAP1Q8N8J0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PI4KAP1Q8N8J0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PI4KAP1Q8N8J0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PI4KAP1Q8N8J0 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PI4KAP1Q8N8J0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PI4KAP1Q8N8J0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PI4KAP1Q8N8J0 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PI4KAP1Q8N8J0 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
PI4KAP1Q8N8J0 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
PI4KAP1Q8N8J0 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PI4KAP1Q8N8J0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PI4KAP1Q8N8J0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PI4KAP1Q8N8J0 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PI4KAP1Q8N8J0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PI4KAP1Q8N8J0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PI4KAP1Q8N8J0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PI4KAP1Q8N8J0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PI4KAP1Q8N8J0 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PI4KAP1Q8N8J0 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PI4KAP1Q8N8J0 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PI4KAP1Q8N8J0 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PI4KAP1Q8N8J0 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PI4KAP1Q8N8J0 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PI4KAP1Q8N8J0 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PI4KAP1Q8N8J0 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PI4KAP1Q8N8J0 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PI4KAP1Q8N8J0 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PI4KAP1Q8N8J0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PI4KAP1Q8N8J0 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PI4KAP1Q8N8J0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PI4KAP1Q8N8J0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PI4KAP1Q8N8J0 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PI4KAP1Q8N8J0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PI4KAP1Q8N8J0 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PI4KAP1Q8N8J0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PI4KAP1Q8N8J0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PI4KAP1Q8N8J0 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PI4KAP1Q8N8J0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PI4KAP1Q8N8J0 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PI4KAP1Q8N8J0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PI4KAP1Q8N8J0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PI4KAP1Q8N8J0 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PI4KAP1Q8N8J0 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PI4KAP1Q8N8J0 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PI4KAP1Q8N8J0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PI4KAP1Q8N8J0 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PI4KAP1Q8N8J0 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PI4KAP1Q8N8J0 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PI4KAP1Q8N8J0 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PI4KAP1Q8N8J0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PI4KAP1Q8N8J0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PI4KAP1Q8N8J0 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms