Protein–RNA interactions for Protein: Q3C1V9

Putative uncharacterized protein ENSP00000334305, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3C1V9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Q3C1V9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Q3C1V9 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Q3C1V9 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Q3C1V9 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Q3C1V9 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Q3C1V9 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Q3C1V9 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Q3C1V9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Q3C1V9 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Q3C1V9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Q3C1V9 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Q3C1V9 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Q3C1V9 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Q3C1V9 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Q3C1V9 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Q3C1V9 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Q3C1V9 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Q3C1V9 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Q3C1V9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Q3C1V9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Q3C1V9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Q3C1V9 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Q3C1V9 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Q3C1V9 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Q3C1V9 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Q3C1V9 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Q3C1V9 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Q3C1V9 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Q3C1V9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Q3C1V9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Q3C1V9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Q3C1V9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Q3C1V9 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Q3C1V9 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Q3C1V9 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Q3C1V9 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Q3C1V9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Q3C1V9 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Q3C1V9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Q3C1V9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Q3C1V9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Q3C1V9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Q3C1V9 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Q3C1V9 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Q3C1V9 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Q3C1V9 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Q3C1V9 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Q3C1V9 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Q3C1V9 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Q3C1V9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Q3C1V9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Q3C1V9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Q3C1V9 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Q3C1V9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Q3C1V9 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Q3C1V9 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Q3C1V9 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Q3C1V9 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Q3C1V9 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Q3C1V9 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Q3C1V9 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Q3C1V9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Q3C1V9 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Q3C1V9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Q3C1V9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Q3C1V9 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Q3C1V9 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Q3C1V9 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Q3C1V9 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Q3C1V9 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Q3C1V9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Q3C1V9 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Q3C1V9 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Q3C1V9 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Q3C1V9 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Q3C1V9 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Q3C1V9 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Q3C1V9 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Q3C1V9 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Q3C1V9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Q3C1V9 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Q3C1V9 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Q3C1V9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Q3C1V9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Q3C1V9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Q3C1V9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Q3C1V9 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Q3C1V9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Q3C1V9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Q3C1V9 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Q3C1V9 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Q3C1V9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Q3C1V9 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Q3C1V9 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Q3C1V9 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Q3C1V9 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Q3C1V9 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Q3C1V9 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Q3C1V9 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms