Protein–RNA interactions for Protein: Q2MV58

TCTN1, Tectonic-1, humanhuman

Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCTN1Q2MV58 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TCTN1Q2MV58 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TCTN1Q2MV58 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TCTN1Q2MV58 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TCTN1Q2MV58 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TCTN1Q2MV58 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TCTN1Q2MV58 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TCTN1Q2MV58 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TCTN1Q2MV58 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TCTN1Q2MV58 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TCTN1Q2MV58 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TCTN1Q2MV58 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TCTN1Q2MV58 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TCTN1Q2MV58 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TCTN1Q2MV58 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TCTN1Q2MV58 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TCTN1Q2MV58 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TCTN1Q2MV58 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TCTN1Q2MV58 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TCTN1Q2MV58 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TCTN1Q2MV58 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TCTN1Q2MV58 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TCTN1Q2MV58 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TCTN1Q2MV58 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TCTN1Q2MV58 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TCTN1Q2MV58 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TCTN1Q2MV58 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TCTN1Q2MV58 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TCTN1Q2MV58 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TCTN1Q2MV58 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TCTN1Q2MV58 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TCTN1Q2MV58 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TCTN1Q2MV58 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TCTN1Q2MV58 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TCTN1Q2MV58 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TCTN1Q2MV58 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TCTN1Q2MV58 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TCTN1Q2MV58 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TCTN1Q2MV58 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TCTN1Q2MV58 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TCTN1Q2MV58 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TCTN1Q2MV58 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TCTN1Q2MV58 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TCTN1Q2MV58 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TCTN1Q2MV58 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TCTN1Q2MV58 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TCTN1Q2MV58 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TCTN1Q2MV58 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TCTN1Q2MV58 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TCTN1Q2MV58 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TCTN1Q2MV58 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TCTN1Q2MV58 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TCTN1Q2MV58 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TCTN1Q2MV58 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TCTN1Q2MV58 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TCTN1Q2MV58 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TCTN1Q2MV58 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TCTN1Q2MV58 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TCTN1Q2MV58 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TCTN1Q2MV58 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TCTN1Q2MV58 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TCTN1Q2MV58 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TCTN1Q2MV58 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TCTN1Q2MV58 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TCTN1Q2MV58 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TCTN1Q2MV58 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TCTN1Q2MV58 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TCTN1Q2MV58 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TCTN1Q2MV58 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TCTN1Q2MV58 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TCTN1Q2MV58 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TCTN1Q2MV58 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TCTN1Q2MV58 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TCTN1Q2MV58 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TCTN1Q2MV58 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TCTN1Q2MV58 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TCTN1Q2MV58 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TCTN1Q2MV58 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TCTN1Q2MV58 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TCTN1Q2MV58 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TCTN1Q2MV58 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TCTN1Q2MV58 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TCTN1Q2MV58 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TCTN1Q2MV58 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TCTN1Q2MV58 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TCTN1Q2MV58 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TCTN1Q2MV58 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TCTN1Q2MV58 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TCTN1Q2MV58 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TCTN1Q2MV58 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TCTN1Q2MV58 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TCTN1Q2MV58 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TCTN1Q2MV58 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TCTN1Q2MV58 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TCTN1Q2MV58 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TCTN1Q2MV58 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TCTN1Q2MV58 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TCTN1Q2MV58 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TCTN1Q2MV58 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TCTN1Q2MV58 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.7 ms