Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL19A1Q14993 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL19A1Q14993 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
COL19A1Q14993 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL19A1Q14993 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL19A1Q14993 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL19A1Q14993 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL19A1Q14993 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL19A1Q14993 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
COL19A1Q14993 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL19A1Q14993 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL19A1Q14993 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL19A1Q14993 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL19A1Q14993 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL19A1Q14993 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL19A1Q14993 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL19A1Q14993 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL19A1Q14993 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL19A1Q14993 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL19A1Q14993 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL19A1Q14993 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
COL19A1Q14993 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL19A1Q14993 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL19A1Q14993 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL19A1Q14993 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COL19A1Q14993 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COL19A1Q14993 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COL19A1Q14993 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
COL19A1Q14993 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COL19A1Q14993 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
COL19A1Q14993 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COL19A1Q14993 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COL19A1Q14993 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COL19A1Q14993 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
COL19A1Q14993 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
COL19A1Q14993 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
COL19A1Q14993 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
COL19A1Q14993 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
COL19A1Q14993 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
COL19A1Q14993 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
COL19A1Q14993 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COL19A1Q14993 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
COL19A1Q14993 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COL19A1Q14993 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
COL19A1Q14993 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COL19A1Q14993 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COL19A1Q14993 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COL19A1Q14993 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COL19A1Q14993 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COL19A1Q14993 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COL19A1Q14993 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COL19A1Q14993 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COL19A1Q14993 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COL19A1Q14993 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COL19A1Q14993 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COL19A1Q14993 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
COL19A1Q14993 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
COL19A1Q14993 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COL19A1Q14993 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COL19A1Q14993 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
COL19A1Q14993 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
COL19A1Q14993 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
COL19A1Q14993 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
COL19A1Q14993 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
COL19A1Q14993 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
COL19A1Q14993 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COL19A1Q14993 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
COL19A1Q14993 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COL19A1Q14993 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
COL19A1Q14993 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COL19A1Q14993 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COL19A1Q14993 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
COL19A1Q14993 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
COL19A1Q14993 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
COL19A1Q14993 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COL19A1Q14993 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
COL19A1Q14993 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
COL19A1Q14993 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
COL19A1Q14993 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
COL19A1Q14993 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COL19A1Q14993 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COL19A1Q14993 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
COL19A1Q14993 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COL19A1Q14993 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COL19A1Q14993 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COL19A1Q14993 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COL19A1Q14993 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COL19A1Q14993 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COL19A1Q14993 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COL19A1Q14993 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COL19A1Q14993 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COL19A1Q14993 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COL19A1Q14993 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COL19A1Q14993 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COL19A1Q14993 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
COL19A1Q14993 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COL19A1Q14993 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COL19A1Q14993 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COL19A1Q14993 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
COL19A1Q14993 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
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