Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HSPB3Q12988 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HSPB3Q12988 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HSPB3Q12988 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HSPB3Q12988 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HSPB3Q12988 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HSPB3Q12988 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HSPB3Q12988 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HSPB3Q12988 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HSPB3Q12988 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HSPB3Q12988 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HSPB3Q12988 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HSPB3Q12988 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HSPB3Q12988 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HSPB3Q12988 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HSPB3Q12988 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
HSPB3Q12988 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HSPB3Q12988 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HSPB3Q12988 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HSPB3Q12988 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HSPB3Q12988 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HSPB3Q12988 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HSPB3Q12988 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HSPB3Q12988 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HSPB3Q12988 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
HSPB3Q12988 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HSPB3Q12988 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HSPB3Q12988 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HSPB3Q12988 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HSPB3Q12988 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HSPB3Q12988 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HSPB3Q12988 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HSPB3Q12988 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HSPB3Q12988 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HSPB3Q12988 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HSPB3Q12988 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HSPB3Q12988 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HSPB3Q12988 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HSPB3Q12988 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HSPB3Q12988 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HSPB3Q12988 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HSPB3Q12988 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HSPB3Q12988 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HSPB3Q12988 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HSPB3Q12988 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HSPB3Q12988 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HSPB3Q12988 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HSPB3Q12988 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HSPB3Q12988 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HSPB3Q12988 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HSPB3Q12988 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HSPB3Q12988 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HSPB3Q12988 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HSPB3Q12988 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HSPB3Q12988 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HSPB3Q12988 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
HSPB3Q12988 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
HSPB3Q12988 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
HSPB3Q12988 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
HSPB3Q12988 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HSPB3Q12988 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HSPB3Q12988 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HSPB3Q12988 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HSPB3Q12988 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HSPB3Q12988 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HSPB3Q12988 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HSPB3Q12988 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HSPB3Q12988 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HSPB3Q12988 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HSPB3Q12988 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HSPB3Q12988 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HSPB3Q12988 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HSPB3Q12988 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
HSPB3Q12988 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HSPB3Q12988 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HSPB3Q12988 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HSPB3Q12988 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HSPB3Q12988 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HSPB3Q12988 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HSPB3Q12988 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
HSPB3Q12988 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HSPB3Q12988 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HSPB3Q12988 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HSPB3Q12988 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HSPB3Q12988 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HSPB3Q12988 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HSPB3Q12988 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HSPB3Q12988 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
HSPB3Q12988 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
HSPB3Q12988 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HSPB3Q12988 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HSPB3Q12988 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HSPB3Q12988 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HSPB3Q12988 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HSPB3Q12988 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HSPB3Q12988 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HSPB3Q12988 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HSPB3Q12988 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
HSPB3Q12988 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
HSPB3Q12988 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
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