Protein–RNA interactions for Protein: P78347

GTF2I, General transcription factor II-I, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IP78347 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GTF2IP78347 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GTF2IP78347 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
GTF2IP78347 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
GTF2IP78347 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GTF2IP78347 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GTF2IP78347 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GTF2IP78347 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GTF2IP78347 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
GTF2IP78347 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GTF2IP78347 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GTF2IP78347 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GTF2IP78347 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
GTF2IP78347 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
GTF2IP78347 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GTF2IP78347 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GTF2IP78347 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GTF2IP78347 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GTF2IP78347 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
GTF2IP78347 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GTF2IP78347 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GTF2IP78347 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GTF2IP78347 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GTF2IP78347 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GTF2IP78347 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GTF2IP78347 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GTF2IP78347 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GTF2IP78347 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GTF2IP78347 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GTF2IP78347 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GTF2IP78347 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GTF2IP78347 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GTF2IP78347 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GTF2IP78347 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GTF2IP78347 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GTF2IP78347 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GTF2IP78347 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GTF2IP78347 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GTF2IP78347 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GTF2IP78347 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GTF2IP78347 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GTF2IP78347 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GTF2IP78347 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GTF2IP78347 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GTF2IP78347 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GTF2IP78347 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
GTF2IP78347 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GTF2IP78347 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GTF2IP78347 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GTF2IP78347 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GTF2IP78347 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GTF2IP78347 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GTF2IP78347 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GTF2IP78347 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GTF2IP78347 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GTF2IP78347 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GTF2IP78347 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GTF2IP78347 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GTF2IP78347 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GTF2IP78347 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GTF2IP78347 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GTF2IP78347 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GTF2IP78347 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GTF2IP78347 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GTF2IP78347 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GTF2IP78347 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GTF2IP78347 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GTF2IP78347 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GTF2IP78347 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
GTF2IP78347 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GTF2IP78347 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GTF2IP78347 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GTF2IP78347 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GTF2IP78347 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GTF2IP78347 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GTF2IP78347 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GTF2IP78347 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GTF2IP78347 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GTF2IP78347 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GTF2IP78347 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GTF2IP78347 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GTF2IP78347 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GTF2IP78347 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GTF2IP78347 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GTF2IP78347 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GTF2IP78347 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
GTF2IP78347 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GTF2IP78347 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GTF2IP78347 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GTF2IP78347 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GTF2IP78347 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GTF2IP78347 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GTF2IP78347 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GTF2IP78347 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GTF2IP78347 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GTF2IP78347 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GTF2IP78347 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GTF2IP78347 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GTF2IP78347 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GTF2IP78347 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.7 ms