Protein–RNA interactions for Protein: P52292

KPNA2, Importin subunit alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA2P52292 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KPNA2P52292 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KPNA2P52292 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KPNA2P52292 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
KPNA2P52292 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KPNA2P52292 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KPNA2P52292 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KPNA2P52292 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
KPNA2P52292 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KPNA2P52292 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KPNA2P52292 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
KPNA2P52292 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KPNA2P52292 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KPNA2P52292 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KPNA2P52292 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KPNA2P52292 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
KPNA2P52292 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KPNA2P52292 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KPNA2P52292 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KPNA2P52292 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
KPNA2P52292 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KPNA2P52292 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
KPNA2P52292 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KPNA2P52292 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KPNA2P52292 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KPNA2P52292 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KPNA2P52292 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KPNA2P52292 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KPNA2P52292 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KPNA2P52292 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KPNA2P52292 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KPNA2P52292 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KPNA2P52292 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KPNA2P52292 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KPNA2P52292 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KPNA2P52292 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KPNA2P52292 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KPNA2P52292 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KPNA2P52292 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KPNA2P52292 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KPNA2P52292 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KPNA2P52292 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KPNA2P52292 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KPNA2P52292 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KPNA2P52292 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KPNA2P52292 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KPNA2P52292 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KPNA2P52292 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KPNA2P52292 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KPNA2P52292 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KPNA2P52292 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KPNA2P52292 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KPNA2P52292 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KPNA2P52292 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KPNA2P52292 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KPNA2P52292 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KPNA2P52292 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KPNA2P52292 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KPNA2P52292 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KPNA2P52292 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KPNA2P52292 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KPNA2P52292 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KPNA2P52292 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KPNA2P52292 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KPNA2P52292 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KPNA2P52292 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KPNA2P52292 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KPNA2P52292 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KPNA2P52292 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KPNA2P52292 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KPNA2P52292 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KPNA2P52292 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KPNA2P52292 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KPNA2P52292 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KPNA2P52292 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KPNA2P52292 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KPNA2P52292 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KPNA2P52292 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KPNA2P52292 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KPNA2P52292 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KPNA2P52292 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KPNA2P52292 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KPNA2P52292 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KPNA2P52292 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KPNA2P52292 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KPNA2P52292 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KPNA2P52292 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KPNA2P52292 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
KPNA2P52292 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KPNA2P52292 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KPNA2P52292 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KPNA2P52292 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KPNA2P52292 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KPNA2P52292 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KPNA2P52292 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KPNA2P52292 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
KPNA2P52292 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KPNA2P52292 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KPNA2P52292 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KPNA2P52292 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms