Protein–RNA interactions for Protein: P42772

CDKN2B, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor B, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN2BP42772 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDKN2BP42772 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDKN2BP42772 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDKN2BP42772 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDKN2BP42772 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDKN2BP42772 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CDKN2BP42772 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDKN2BP42772 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDKN2BP42772 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDKN2BP42772 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDKN2BP42772 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDKN2BP42772 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDKN2BP42772 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDKN2BP42772 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDKN2BP42772 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CDKN2BP42772 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDKN2BP42772 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDKN2BP42772 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDKN2BP42772 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDKN2BP42772 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDKN2BP42772 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDKN2BP42772 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CDKN2BP42772 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDKN2BP42772 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDKN2BP42772 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDKN2BP42772 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDKN2BP42772 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDKN2BP42772 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDKN2BP42772 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDKN2BP42772 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDKN2BP42772 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDKN2BP42772 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDKN2BP42772 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDKN2BP42772 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDKN2BP42772 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDKN2BP42772 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDKN2BP42772 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDKN2BP42772 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDKN2BP42772 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CDKN2BP42772 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDKN2BP42772 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDKN2BP42772 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CDKN2BP42772 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDKN2BP42772 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDKN2BP42772 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDKN2BP42772 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDKN2BP42772 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDKN2BP42772 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDKN2BP42772 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDKN2BP42772 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDKN2BP42772 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDKN2BP42772 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDKN2BP42772 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDKN2BP42772 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDKN2BP42772 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDKN2BP42772 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDKN2BP42772 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDKN2BP42772 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDKN2BP42772 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDKN2BP42772 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CDKN2BP42772 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDKN2BP42772 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDKN2BP42772 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDKN2BP42772 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDKN2BP42772 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDKN2BP42772 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDKN2BP42772 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDKN2BP42772 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CDKN2BP42772 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDKN2BP42772 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDKN2BP42772 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDKN2BP42772 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDKN2BP42772 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDKN2BP42772 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDKN2BP42772 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDKN2BP42772 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDKN2BP42772 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDKN2BP42772 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDKN2BP42772 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDKN2BP42772 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDKN2BP42772 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDKN2BP42772 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDKN2BP42772 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDKN2BP42772 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDKN2BP42772 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDKN2BP42772 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDKN2BP42772 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDKN2BP42772 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDKN2BP42772 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDKN2BP42772 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDKN2BP42772 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDKN2BP42772 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDKN2BP42772 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDKN2BP42772 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDKN2BP42772 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDKN2BP42772 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDKN2BP42772 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDKN2BP42772 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDKN2BP42772 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDKN2BP42772 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms