Protein–RNA interactions for Protein: P25441

RPC53, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC4, yeast

Predictions only

Length 422 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPC53	P25441	XKS1	YGR194C	1803 nt		4.6	□□□□□ -1.67
RPC53	P25441	ALE1	YOR175C	1860 nt		4.6	□□□□□ -1.67
RPC53	P25441	YGL118C	YGL118C	438 nt		4.6	□□□□□ -1.67
RPC53	P25441	YLR225C	YLR225C	1224 nt		4.6	□□□□□ -1.67
RPC53	P25441	RAD17	YOR368W	1206 nt		4.6	□□□□□ -1.67
RPC53	P25441	NAM9	YNL137C	1461 nt		4.6	□□□□□ -1.67
RPC53	P25441	LAS1	YKR063C	1509 nt		4.6	□□□□□ -1.67
RPC53	P25441	SYF1	YDR416W	2580 nt		4.59	□□□□□ -1.67
RPC53	P25441	BRE4	YDL231C	3378 nt		4.59	□□□□□ -1.67
RPC53	P25441	KIN2	YLR096W	3444 nt		4.59	□□□□□ -1.67
RPC53	P25441	RPC53	YDL150W	1269 nt		4.59	□□□□□ -1.67
RPC53	P25441	UGA3	YDL170W	1587 nt		4.59	□□□□□ -1.67
RPC53	P25441	SSB1	YDL229W	1842 nt		4.59	□□□□□ -1.67
RPC53	P25441	THI13	YDL244W	1023 nt		4.59	□□□□□ -1.67
RPC53	P25441	DIT2	YDR402C	1470 nt		4.59	□□□□□ -1.67
RPC53	P25441	API2	YDR525W	330 nt		4.59	□□□□□ -1.67
RPC53	P25441	THI11	YJR156C	1023 nt		4.59	□□□□□ -1.67
RPC53	P25441	FAR10	YLR238W	1437 nt		4.59	□□□□□ -1.67
RPC53	P25441	TDA5	YLR426W	981 nt		4.59	□□□□□ -1.67
RPC53	P25441	TRM11	YOL124C	1302 nt		4.59	□□□□□ -1.67
RPC53	P25441	VBA2	YBR293W	1425 nt		4.59	□□□□□ -1.67
RPC53	P25441	UBP10	YNL186W	2379 nt		4.58	□□□□□ -1.68
RPC53	P25441	RCM1	YNL022C	1473 nt		4.58	□□□□□ -1.68
RPC53	P25441	TYR1	YBR166C	1359 nt		4.58	□□□□□ -1.68
RPC53	P25441	YRB30	YGL164C	1323 nt		4.58	□□□□□ -1.68
RPC53	P25441	MED2	YDL005C	1296 nt		4.58	□□□□□ -1.68
RPC53	P25441	YDR282C	YDR282C	1245 nt		4.58	□□□□□ -1.68
RPC53	P25441	RPL24A	YGL031C	468 nt		4.58	□□□□□ -1.68
RPC53	P25441	TYS1	YGR185C	1185 nt		4.58	□□□□□ -1.68
RPC53	P25441	ERD2	YBL040C	660 nt		4.58	□□□□□ -1.68
RPC53	P25441	PBN1	YCL052C	1251 nt		4.58	□□□□□ -1.68
RPC53	P25441	GRC3	YLL035W	1899 nt		4.58	□□□□□ -1.68
RPC53	P25441	IZH3	YLR023C	1632 nt		4.57	□□□□□ -1.68
RPC53	P25441	TMA17	YDL110C	453 nt		4.57	□□□□□ -1.68
RPC53	P25441	YGL101W	YGL101W	648 nt		4.57	□□□□□ -1.68
RPC53	P25441	SRB5	YGR104C	924 nt		4.57	□□□□□ -1.68
RPC53	P25441	EFB1	YAL003W	621 nt		4.57	□□□□□ -1.68
RPC53	P25441	SFH5	YJL145W	885 nt		4.57	□□□□□ -1.68
RPC53	P25441	RDN5-1	RDN5-1	121 nt		4.57	□□□□□ -1.68
RPC53	P25441	RDN5-6	RDN5-6	121 nt		4.57	□□□□□ -1.68
RPC53	P25441	CBP3	YPL215W	1008 nt		4.57	□□□□□ -1.68
RPC53	P25441	SWP82	YFL049W	1872 nt		4.57	□□□□□ -1.68
RPC53	P25441	MDM38	YOL027C	1722 nt		4.57	□□□□□ -1.68
RPC53	P25441	HPR1	YDR138W	2259 nt		4.57	□□□□□ -1.68
RPC53	P25441	YER077C	YER077C	2067 nt		4.57	□□□□□ -1.68
RPC53	P25441	RTK1	YDL025C	1863 nt		4.56	□□□□□ -1.68
RPC53	P25441	MSK1	YNL073W	1731 nt		4.56	□□□□□ -1.68
RPC53	P25441	DCV1	YFR012W	609 nt		4.56	□□□□□ -1.68
RPC53	P25441	MSA2	YKR077W	1092 nt		4.56	□□□□□ -1.68
RPC53	P25441	SUI1	YNL244C	327 nt		4.56	□□□□□ -1.68
RPC53	P25441	NCE102	YPR149W	522 nt		4.56	□□□□□ -1.68
RPC53	P25441	SIP1	YDR422C	2448 nt		4.56	□□□□□ -1.68
RPC53	P25441	SPC105	YGL093W	2754 nt		4.56	□□□□□ -1.68
RPC53	P25441	MNN1	YER001W	2289 nt		4.56	□□□□□ -1.68
RPC53	P25441	PDR5	YOR153W	4536 nt		4.55	□□□□□ -1.68
RPC53	P25441	PMC1	YGL006W	3522 nt		4.55	□□□□□ -1.68
RPC53	P25441	AIM7	YDR063W	450 nt		4.55	□□□□□ -1.68
RPC53	P25441	MCM21	YDR318W	1107 nt		4.55	□□□□□ -1.68
RPC53	P25441	BUD25	YER014C-A	462 nt		4.55	□□□□□ -1.68
RPC53	P25441	MIC26	YGR235C	702 nt		4.55	□□□□□ -1.68
RPC53	P25441	MRP4	YHL004W	1185 nt		4.55	□□□□□ -1.68
RPC53	P25441	CPR3	YML078W	549 nt		4.55	□□□□□ -1.68
RPC53	P25441	INA17	YPL099C	549 nt		4.55	□□□□□ -1.68
RPC53	P25441	snR34	snR34	203 nt		4.55	□□□□□ -1.68
RPC53	P25441	CDC15	YAR019C	2925 nt		4.55	□□□□□ -1.68
RPC53	P25441	RAD7	YJR052W	1698 nt		4.54	□□□□□ -1.68
RPC53	P25441	FLC1	YPL221W	2382 nt		4.54	□□□□□ -1.68
RPC53	P25441	URC2	YDR520C	2319 nt		4.54	□□□□□ -1.68
RPC53	P25441	PTC1	YDL006W	846 nt		4.54	□□□□□ -1.68
RPC53	P25441	YJL218W	YJL218W	591 nt		4.54	□□□□□ -1.68
RPC53	P25441	TTI2	YJR136C	1266 nt		4.54	□□□□□ -1.68
RPC53	P25441	MRPL3	YMR024W	1173 nt		4.54	□□□□□ -1.68
RPC53	P25441	PEX12	YMR026C	1200 nt		4.54	□□□□□ -1.68
RPC53	P25441	DSS4	YPR017C	432 nt		4.54	□□□□□ -1.68
RPC53	P25441	CNS1	YBR155W	1158 nt		4.54	□□□□□ -1.68
RPC53	P25441	OM14	YBR230C	405 nt		4.54	□□□□□ -1.68
RPC53	P25441	RDH54	YBR073W	2877 nt		4.54	□□□□□ -1.68
RPC53	P25441	PHO84	YML123C	1764 nt		4.53	□□□□□ -1.68
RPC53	P25441	APP1	YNL094W	1764 nt		4.53	□□□□□ -1.68
RPC53	P25441	PAF1	YBR279W	1338 nt		4.53	□□□□□ -1.68
RPC53	P25441	YDL094C	YDL094C	510 nt		4.53	□□□□□ -1.68
RPC53	P25441	snR7-L	snR7-L	214 nt		4.53	□□□□□ -1.68
RPC53	P25441	BCP1	YDR361C	852 nt		4.53	□□□□□ -1.68
RPC53	P25441	UBC8	YEL012W	657 nt		4.53	□□□□□ -1.68
RPC53	P25441	YJR038C	YJR038C	363 nt		4.53	□□□□□ -1.68
RPC53	P25441	GPI12	YMR281W	915 nt		4.53	□□□□□ -1.68
RPC53	P25441	POP3	YNL282W	588 nt		4.53	□□□□□ -1.68
RPC53	P25441	MDM12	YOL009C	816 nt		4.53	□□□□□ -1.68
RPC53	P25441	VPS69	YPR087W	321 nt		4.53	□□□□□ -1.68
RPC53	P25441	FDC1	YDR539W	1512 nt		4.52	□□□□□ -1.69
RPC53	P25441	EMP47	YFL048C	1338 nt		4.52	□□□□□ -1.69
RPC53	P25441	DPB4	YDR121W	591 nt		4.52	□□□□□ -1.69
RPC53	P25441	YDR246W-A	YDR246W-A	201 nt		4.52	□□□□□ -1.69
RPC53	P25441	YHB1	YGR234W	1200 nt		4.52	□□□□□ -1.69
RPC53	P25441	SPO16	YHR153C	597 nt		4.52	□□□□□ -1.69
RPC53	P25441	MMM1	YLL006W	1281 nt		4.52	□□□□□ -1.69
RPC53	P25441	YLR049C	YLR049C	1287 nt		4.52	□□□□□ -1.69
RPC53	P25441	SEC72	YLR292C	582 nt		4.52	□□□□□ -1.69
RPC53	P25441	HEK2	YBL032W	1146 nt		4.52	□□□□□ -1.69
RPC53	P25441	YOR131C	YOR131C	657 nt		4.52	□□□□□ -1.69

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.4 ms