Protein–RNA interactions for Protein: P15428

HPGD, 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase [NAD(+)], humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPGDP15428 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HPGDP15428 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HPGDP15428 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HPGDP15428 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
HPGDP15428 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HPGDP15428 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HPGDP15428 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HPGDP15428 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HPGDP15428 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HPGDP15428 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HPGDP15428 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HPGDP15428 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HPGDP15428 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HPGDP15428 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HPGDP15428 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HPGDP15428 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HPGDP15428 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
HPGDP15428 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HPGDP15428 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HPGDP15428 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HPGDP15428 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
HPGDP15428 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
HPGDP15428 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
HPGDP15428 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HPGDP15428 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HPGDP15428 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HPGDP15428 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HPGDP15428 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HPGDP15428 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HPGDP15428 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HPGDP15428 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
HPGDP15428 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HPGDP15428 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HPGDP15428 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HPGDP15428 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HPGDP15428 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HPGDP15428 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HPGDP15428 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HPGDP15428 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HPGDP15428 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HPGDP15428 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HPGDP15428 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HPGDP15428 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HPGDP15428 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HPGDP15428 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HPGDP15428 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HPGDP15428 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HPGDP15428 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HPGDP15428 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HPGDP15428 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HPGDP15428 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
HPGDP15428 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HPGDP15428 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HPGDP15428 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HPGDP15428 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
HPGDP15428 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HPGDP15428 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
HPGDP15428 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
HPGDP15428 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HPGDP15428 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HPGDP15428 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HPGDP15428 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HPGDP15428 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HPGDP15428 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HPGDP15428 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HPGDP15428 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HPGDP15428 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HPGDP15428 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HPGDP15428 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HPGDP15428 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
HPGDP15428 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HPGDP15428 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HPGDP15428 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HPGDP15428 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HPGDP15428 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HPGDP15428 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HPGDP15428 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HPGDP15428 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HPGDP15428 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HPGDP15428 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
HPGDP15428 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
HPGDP15428 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HPGDP15428 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
HPGDP15428 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
HPGDP15428 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HPGDP15428 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HPGDP15428 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HPGDP15428 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HPGDP15428 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HPGDP15428 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HPGDP15428 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HPGDP15428 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HPGDP15428 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HPGDP15428 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HPGDP15428 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HPGDP15428 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HPGDP15428 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HPGDP15428 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HPGDP15428 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HPGDP15428 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143 ms