Protein–RNA interactions for Protein: P11940

PABPC1, Polyadenylate-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC1P11940 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PABPC1P11940 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PABPC1P11940 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PABPC1P11940 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PABPC1P11940 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PABPC1P11940 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PABPC1P11940 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PABPC1P11940 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PABPC1P11940 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PABPC1P11940 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PABPC1P11940 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PABPC1P11940 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PABPC1P11940 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PABPC1P11940 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PABPC1P11940 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PABPC1P11940 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PABPC1P11940 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PABPC1P11940 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PABPC1P11940 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PABPC1P11940 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PABPC1P11940 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PABPC1P11940 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PABPC1P11940 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PABPC1P11940 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PABPC1P11940 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PABPC1P11940 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PABPC1P11940 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PABPC1P11940 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PABPC1P11940 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PABPC1P11940 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PABPC1P11940 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PABPC1P11940 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PABPC1P11940 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PABPC1P11940 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PABPC1P11940 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PABPC1P11940 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PABPC1P11940 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PABPC1P11940 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PABPC1P11940 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PABPC1P11940 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PABPC1P11940 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PABPC1P11940 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PABPC1P11940 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PABPC1P11940 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PABPC1P11940 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PABPC1P11940 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PABPC1P11940 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PABPC1P11940 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PABPC1P11940 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PABPC1P11940 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PABPC1P11940 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PABPC1P11940 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PABPC1P11940 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PABPC1P11940 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PABPC1P11940 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PABPC1P11940 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PABPC1P11940 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PABPC1P11940 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PABPC1P11940 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PABPC1P11940 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PABPC1P11940 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PABPC1P11940 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PABPC1P11940 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PABPC1P11940 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PABPC1P11940 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PABPC1P11940 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PABPC1P11940 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PABPC1P11940 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PABPC1P11940 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PABPC1P11940 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PABPC1P11940 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PABPC1P11940 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PABPC1P11940 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PABPC1P11940 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PABPC1P11940 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PABPC1P11940 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PABPC1P11940 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PABPC1P11940 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PABPC1P11940 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PABPC1P11940 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PABPC1P11940 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PABPC1P11940 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PABPC1P11940 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PABPC1P11940 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PABPC1P11940 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PABPC1P11940 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PABPC1P11940 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PABPC1P11940 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PABPC1P11940 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PABPC1P11940 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PABPC1P11940 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PABPC1P11940 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PABPC1P11940 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PABPC1P11940 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PABPC1P11940 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PABPC1P11940 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PABPC1P11940 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PABPC1P11940 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PABPC1P11940 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PABPC1P11940 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.9 ms