Protein–RNA interactions for Protein: O75054

IGSF3, Immunoglobulin superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF3O75054 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
IGSF3O75054 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
IGSF3O75054 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
IGSF3O75054 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
IGSF3O75054 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
IGSF3O75054 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
IGSF3O75054 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
IGSF3O75054 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
IGSF3O75054 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
IGSF3O75054 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
IGSF3O75054 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
IGSF3O75054 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
IGSF3O75054 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
IGSF3O75054 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
IGSF3O75054 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
IGSF3O75054 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
IGSF3O75054 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
IGSF3O75054 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
IGSF3O75054 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
IGSF3O75054 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
IGSF3O75054 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
IGSF3O75054 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
IGSF3O75054 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
IGSF3O75054 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
IGSF3O75054 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
IGSF3O75054 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
IGSF3O75054 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
IGSF3O75054 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
IGSF3O75054 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
IGSF3O75054 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
IGSF3O75054 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
IGSF3O75054 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
IGSF3O75054 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
IGSF3O75054 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
IGSF3O75054 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
IGSF3O75054 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
IGSF3O75054 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
IGSF3O75054 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
IGSF3O75054 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
IGSF3O75054 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
IGSF3O75054 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
IGSF3O75054 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
IGSF3O75054 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
IGSF3O75054 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
IGSF3O75054 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
IGSF3O75054 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
IGSF3O75054 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
IGSF3O75054 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
IGSF3O75054 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
IGSF3O75054 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
IGSF3O75054 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
IGSF3O75054 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
IGSF3O75054 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
IGSF3O75054 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
IGSF3O75054 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
IGSF3O75054 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
IGSF3O75054 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
IGSF3O75054 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
IGSF3O75054 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
IGSF3O75054 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
IGSF3O75054 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
IGSF3O75054 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
IGSF3O75054 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
IGSF3O75054 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
IGSF3O75054 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
IGSF3O75054 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
IGSF3O75054 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
IGSF3O75054 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
IGSF3O75054 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
IGSF3O75054 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
IGSF3O75054 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
IGSF3O75054 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
IGSF3O75054 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
IGSF3O75054 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
IGSF3O75054 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
IGSF3O75054 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
IGSF3O75054 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
IGSF3O75054 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
IGSF3O75054 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
IGSF3O75054 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
IGSF3O75054 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
IGSF3O75054 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
IGSF3O75054 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
IGSF3O75054 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
IGSF3O75054 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
IGSF3O75054 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
IGSF3O75054 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
IGSF3O75054 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
IGSF3O75054 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
IGSF3O75054 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
IGSF3O75054 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
IGSF3O75054 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
IGSF3O75054 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
IGSF3O75054 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
IGSF3O75054 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
IGSF3O75054 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
IGSF3O75054 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
IGSF3O75054 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
IGSF3O75054 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
IGSF3O75054 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.9 ms