Protein–RNA interactions for Protein: J3KRW8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

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Length 73 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KRW8 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
J3KRW8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
J3KRW8 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
J3KRW8 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
J3KRW8 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
J3KRW8 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
J3KRW8 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
J3KRW8 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
J3KRW8 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
J3KRW8 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
J3KRW8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
J3KRW8 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
J3KRW8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
J3KRW8 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
J3KRW8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
J3KRW8 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
J3KRW8 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
J3KRW8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
J3KRW8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
J3KRW8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
J3KRW8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
J3KRW8 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
J3KRW8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
J3KRW8 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
J3KRW8 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
J3KRW8 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
J3KRW8 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
J3KRW8 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
J3KRW8 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
J3KRW8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
J3KRW8 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
J3KRW8 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
J3KRW8 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
J3KRW8 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
J3KRW8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
J3KRW8 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
J3KRW8 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
J3KRW8 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
J3KRW8 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
J3KRW8 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
J3KRW8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
J3KRW8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
J3KRW8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
J3KRW8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
J3KRW8 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
J3KRW8 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
J3KRW8 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
J3KRW8 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
J3KRW8 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
J3KRW8 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
J3KRW8 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
J3KRW8 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
J3KRW8 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
J3KRW8 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
J3KRW8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
J3KRW8 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
J3KRW8 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
J3KRW8 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
J3KRW8 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
J3KRW8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
J3KRW8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
J3KRW8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
J3KRW8 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
J3KRW8 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
J3KRW8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
J3KRW8 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
J3KRW8 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
J3KRW8 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
J3KRW8 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
J3KRW8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
J3KRW8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
J3KRW8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
J3KRW8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
J3KRW8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
J3KRW8 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
J3KRW8 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
J3KRW8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
J3KRW8 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
J3KRW8 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
J3KRW8 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
J3KRW8 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
J3KRW8 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
J3KRW8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
J3KRW8 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
J3KRW8 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
J3KRW8 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
J3KRW8 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
J3KRW8 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
J3KRW8 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
J3KRW8 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
J3KRW8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
J3KRW8 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
J3KRW8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
J3KRW8 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
J3KRW8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
J3KRW8 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
J3KRW8 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
J3KRW8 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
J3KRW8 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
J3KRW8 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
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