Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
ARID3CA6NKF2 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
ARID3CA6NKF2 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
ARID3CA6NKF2 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
ARID3CA6NKF2 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC34.88■■■■□ 3.17
ARID3CA6NKF2 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC34.88■■■■□ 3.17
ARID3CA6NKF2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
ARID3CA6NKF2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
ARID3CA6NKF2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
ARID3CA6NKF2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
ARID3CA6NKF2 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
ARID3CA6NKF2 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
ARID3CA6NKF2 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
ARID3CA6NKF2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
ARID3CA6NKF2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
ARID3CA6NKF2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
ARID3CA6NKF2 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
ARID3CA6NKF2 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
ARID3CA6NKF2 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
ARID3CA6NKF2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
ARID3CA6NKF2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
ARID3CA6NKF2 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
ARID3CA6NKF2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
ARID3CA6NKF2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
ARID3CA6NKF2 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
ARID3CA6NKF2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
ARID3CA6NKF2 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
ARID3CA6NKF2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
ARID3CA6NKF2 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
ARID3CA6NKF2 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
ARID3CA6NKF2 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
ARID3CA6NKF2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
ARID3CA6NKF2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
ARID3CA6NKF2 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
ARID3CA6NKF2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
ARID3CA6NKF2 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
ARID3CA6NKF2 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
ARID3CA6NKF2 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC34.83■■■■□ 3.17
ARID3CA6NKF2 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC34.83■■■■□ 3.17
ARID3CA6NKF2 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
ARID3CA6NKF2 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
ARID3CA6NKF2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
ARID3CA6NKF2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
ARID3CA6NKF2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
ARID3CA6NKF2 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
ARID3CA6NKF2 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
ARID3CA6NKF2 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
ARID3CA6NKF2 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
ARID3CA6NKF2 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
ARID3CA6NKF2 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
ARID3CA6NKF2 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
ARID3CA6NKF2 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
ARID3CA6NKF2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
ARID3CA6NKF2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
ARID3CA6NKF2 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
ARID3CA6NKF2 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
ARID3CA6NKF2 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
ARID3CA6NKF2 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
ARID3CA6NKF2 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
ARID3CA6NKF2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
ARID3CA6NKF2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
ARID3CA6NKF2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
ARID3CA6NKF2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
ARID3CA6NKF2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
ARID3CA6NKF2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
ARID3CA6NKF2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
ARID3CA6NKF2 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
ARID3CA6NKF2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
ARID3CA6NKF2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
ARID3CA6NKF2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
ARID3CA6NKF2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
ARID3CA6NKF2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
ARID3CA6NKF2 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
ARID3CA6NKF2 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
ARID3CA6NKF2 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
ARID3CA6NKF2 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC34.79■■■■□ 3.16
ARID3CA6NKF2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
ARID3CA6NKF2 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
ARID3CA6NKF2 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
ARID3CA6NKF2 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
ARID3CA6NKF2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
ARID3CA6NKF2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
ARID3CA6NKF2 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
ARID3CA6NKF2 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC34.77■■■■□ 3.16
ARID3CA6NKF2 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
ARID3CA6NKF2 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
ARID3CA6NKF2 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
ARID3CA6NKF2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.16
ARID3CA6NKF2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
ARID3CA6NKF2 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.16
ARID3CA6NKF2 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.16
ARID3CA6NKF2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC34.76■■■■□ 3.15
ARID3CA6NKF2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC34.76■■■■□ 3.15
ARID3CA6NKF2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC34.75■■■■□ 3.15
ARID3CA6NKF2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
ARID3CA6NKF2 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
ARID3CA6NKF2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
ARID3CA6NKF2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
ARID3CA6NKF2 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
ARID3CA6NKF2 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms