Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GOLGA6L9A6NEM1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GOLGA6L9A6NEM1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GOLGA6L9A6NEM1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GOLGA6L9A6NEM1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GOLGA6L9A6NEM1 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GOLGA6L9A6NEM1 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GOLGA6L9A6NEM1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GOLGA6L9A6NEM1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GOLGA6L9A6NEM1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GOLGA6L9A6NEM1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GOLGA6L9A6NEM1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GOLGA6L9A6NEM1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GOLGA6L9A6NEM1 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
GOLGA6L9A6NEM1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GOLGA6L9A6NEM1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
GOLGA6L9A6NEM1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GOLGA6L9A6NEM1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GOLGA6L9A6NEM1 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GOLGA6L9A6NEM1 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GOLGA6L9A6NEM1 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GOLGA6L9A6NEM1 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GOLGA6L9A6NEM1 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GOLGA6L9A6NEM1 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GOLGA6L9A6NEM1 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GOLGA6L9A6NEM1 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GOLGA6L9A6NEM1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GOLGA6L9A6NEM1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GOLGA6L9A6NEM1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
GOLGA6L9A6NEM1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GOLGA6L9A6NEM1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
GOLGA6L9A6NEM1 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GOLGA6L9A6NEM1 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GOLGA6L9A6NEM1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GOLGA6L9A6NEM1 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GOLGA6L9A6NEM1 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GOLGA6L9A6NEM1 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GOLGA6L9A6NEM1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GOLGA6L9A6NEM1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GOLGA6L9A6NEM1 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GOLGA6L9A6NEM1 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GOLGA6L9A6NEM1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GOLGA6L9A6NEM1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GOLGA6L9A6NEM1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GOLGA6L9A6NEM1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GOLGA6L9A6NEM1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GOLGA6L9A6NEM1 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GOLGA6L9A6NEM1 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GOLGA6L9A6NEM1 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GOLGA6L9A6NEM1 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GOLGA6L9A6NEM1 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GOLGA6L9A6NEM1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GOLGA6L9A6NEM1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GOLGA6L9A6NEM1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GOLGA6L9A6NEM1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
GOLGA6L9A6NEM1 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GOLGA6L9A6NEM1 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GOLGA6L9A6NEM1 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GOLGA6L9A6NEM1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GOLGA6L9A6NEM1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GOLGA6L9A6NEM1 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GOLGA6L9A6NEM1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GOLGA6L9A6NEM1 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GOLGA6L9A6NEM1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GOLGA6L9A6NEM1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GOLGA6L9A6NEM1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GOLGA6L9A6NEM1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GOLGA6L9A6NEM1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GOLGA6L9A6NEM1 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GOLGA6L9A6NEM1 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GOLGA6L9A6NEM1 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GOLGA6L9A6NEM1 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GOLGA6L9A6NEM1 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GOLGA6L9A6NEM1 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GOLGA6L9A6NEM1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GOLGA6L9A6NEM1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GOLGA6L9A6NEM1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GOLGA6L9A6NEM1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GOLGA6L9A6NEM1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
GOLGA6L9A6NEM1 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GOLGA6L9A6NEM1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GOLGA6L9A6NEM1 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GOLGA6L9A6NEM1 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GOLGA6L9A6NEM1 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GOLGA6L9A6NEM1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GOLGA6L9A6NEM1 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GOLGA6L9A6NEM1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GOLGA6L9A6NEM1 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GOLGA6L9A6NEM1 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GOLGA6L9A6NEM1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GOLGA6L9A6NEM1 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GOLGA6L9A6NEM1 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GOLGA6L9A6NEM1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GOLGA6L9A6NEM1 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GOLGA6L9A6NEM1 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GOLGA6L9A6NEM1 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GOLGA6L9A6NEM1 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms