Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ49

NEU3, Sialidase-3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEU3Q9UQ49 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEU3Q9UQ49 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEU3Q9UQ49 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEU3Q9UQ49 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEU3Q9UQ49 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEU3Q9UQ49 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEU3Q9UQ49 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEU3Q9UQ49 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEU3Q9UQ49 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEU3Q9UQ49 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEU3Q9UQ49 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEU3Q9UQ49 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEU3Q9UQ49 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEU3Q9UQ49 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEU3Q9UQ49 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEU3Q9UQ49 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEU3Q9UQ49 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEU3Q9UQ49 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEU3Q9UQ49 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEU3Q9UQ49 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEU3Q9UQ49 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEU3Q9UQ49 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEU3Q9UQ49 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEU3Q9UQ49 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEU3Q9UQ49 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NEU3Q9UQ49 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NEU3Q9UQ49 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEU3Q9UQ49 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NEU3Q9UQ49 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEU3Q9UQ49 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEU3Q9UQ49 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEU3Q9UQ49 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEU3Q9UQ49 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEU3Q9UQ49 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEU3Q9UQ49 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEU3Q9UQ49 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEU3Q9UQ49 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEU3Q9UQ49 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEU3Q9UQ49 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEU3Q9UQ49 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEU3Q9UQ49 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEU3Q9UQ49 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
NEU3Q9UQ49 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEU3Q9UQ49 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEU3Q9UQ49 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEU3Q9UQ49 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEU3Q9UQ49 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEU3Q9UQ49 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEU3Q9UQ49 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEU3Q9UQ49 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEU3Q9UQ49 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEU3Q9UQ49 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NEU3Q9UQ49 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NEU3Q9UQ49 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEU3Q9UQ49 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEU3Q9UQ49 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEU3Q9UQ49 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEU3Q9UQ49 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEU3Q9UQ49 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEU3Q9UQ49 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEU3Q9UQ49 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NEU3Q9UQ49 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEU3Q9UQ49 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEU3Q9UQ49 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEU3Q9UQ49 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEU3Q9UQ49 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEU3Q9UQ49 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEU3Q9UQ49 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEU3Q9UQ49 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEU3Q9UQ49 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEU3Q9UQ49 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEU3Q9UQ49 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEU3Q9UQ49 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEU3Q9UQ49 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEU3Q9UQ49 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEU3Q9UQ49 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEU3Q9UQ49 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEU3Q9UQ49 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEU3Q9UQ49 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEU3Q9UQ49 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEU3Q9UQ49 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEU3Q9UQ49 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEU3Q9UQ49 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEU3Q9UQ49 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEU3Q9UQ49 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEU3Q9UQ49 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEU3Q9UQ49 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEU3Q9UQ49 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NEU3Q9UQ49 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEU3Q9UQ49 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEU3Q9UQ49 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEU3Q9UQ49 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEU3Q9UQ49 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEU3Q9UQ49 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEU3Q9UQ49 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEU3Q9UQ49 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NEU3Q9UQ49 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEU3Q9UQ49 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NEU3Q9UQ49 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEU3Q9UQ49 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms