Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKG1

APPL1, DCC-interacting protein 13-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APPL1Q9UKG1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APPL1Q9UKG1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APPL1Q9UKG1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APPL1Q9UKG1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
APPL1Q9UKG1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APPL1Q9UKG1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APPL1Q9UKG1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APPL1Q9UKG1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APPL1Q9UKG1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APPL1Q9UKG1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APPL1Q9UKG1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APPL1Q9UKG1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APPL1Q9UKG1 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APPL1Q9UKG1 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APPL1Q9UKG1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APPL1Q9UKG1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APPL1Q9UKG1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APPL1Q9UKG1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APPL1Q9UKG1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APPL1Q9UKG1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APPL1Q9UKG1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APPL1Q9UKG1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APPL1Q9UKG1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APPL1Q9UKG1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
APPL1Q9UKG1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APPL1Q9UKG1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APPL1Q9UKG1 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APPL1Q9UKG1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APPL1Q9UKG1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APPL1Q9UKG1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APPL1Q9UKG1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APPL1Q9UKG1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APPL1Q9UKG1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APPL1Q9UKG1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APPL1Q9UKG1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APPL1Q9UKG1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APPL1Q9UKG1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APPL1Q9UKG1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APPL1Q9UKG1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APPL1Q9UKG1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APPL1Q9UKG1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
APPL1Q9UKG1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APPL1Q9UKG1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APPL1Q9UKG1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APPL1Q9UKG1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APPL1Q9UKG1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APPL1Q9UKG1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
APPL1Q9UKG1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
APPL1Q9UKG1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APPL1Q9UKG1 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APPL1Q9UKG1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APPL1Q9UKG1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APPL1Q9UKG1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APPL1Q9UKG1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APPL1Q9UKG1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APPL1Q9UKG1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APPL1Q9UKG1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APPL1Q9UKG1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APPL1Q9UKG1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APPL1Q9UKG1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APPL1Q9UKG1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
APPL1Q9UKG1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
APPL1Q9UKG1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
APPL1Q9UKG1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
APPL1Q9UKG1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APPL1Q9UKG1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
APPL1Q9UKG1 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APPL1Q9UKG1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APPL1Q9UKG1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
APPL1Q9UKG1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APPL1Q9UKG1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APPL1Q9UKG1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APPL1Q9UKG1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
APPL1Q9UKG1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APPL1Q9UKG1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APPL1Q9UKG1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APPL1Q9UKG1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APPL1Q9UKG1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APPL1Q9UKG1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APPL1Q9UKG1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APPL1Q9UKG1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APPL1Q9UKG1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APPL1Q9UKG1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APPL1Q9UKG1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APPL1Q9UKG1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
APPL1Q9UKG1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APPL1Q9UKG1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APPL1Q9UKG1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APPL1Q9UKG1 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APPL1Q9UKG1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APPL1Q9UKG1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APPL1Q9UKG1 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APPL1Q9UKG1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APPL1Q9UKG1 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APPL1Q9UKG1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APPL1Q9UKG1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APPL1Q9UKG1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APPL1Q9UKG1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APPL1Q9UKG1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
APPL1Q9UKG1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms