Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RABGEF1Q9UJ41 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RABGEF1Q9UJ41 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RABGEF1Q9UJ41 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RABGEF1Q9UJ41 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RABGEF1Q9UJ41 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RABGEF1Q9UJ41 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RABGEF1Q9UJ41 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RABGEF1Q9UJ41 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RABGEF1Q9UJ41 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RABGEF1Q9UJ41 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RABGEF1Q9UJ41 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RABGEF1Q9UJ41 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RABGEF1Q9UJ41 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RABGEF1Q9UJ41 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RABGEF1Q9UJ41 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RABGEF1Q9UJ41 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RABGEF1Q9UJ41 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RABGEF1Q9UJ41 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RABGEF1Q9UJ41 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RABGEF1Q9UJ41 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RABGEF1Q9UJ41 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RABGEF1Q9UJ41 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RABGEF1Q9UJ41 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RABGEF1Q9UJ41 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RABGEF1Q9UJ41 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RABGEF1Q9UJ41 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RABGEF1Q9UJ41 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RABGEF1Q9UJ41 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RABGEF1Q9UJ41 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RABGEF1Q9UJ41 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RABGEF1Q9UJ41 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RABGEF1Q9UJ41 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RABGEF1Q9UJ41 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RABGEF1Q9UJ41 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RABGEF1Q9UJ41 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RABGEF1Q9UJ41 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RABGEF1Q9UJ41 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RABGEF1Q9UJ41 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RABGEF1Q9UJ41 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RABGEF1Q9UJ41 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RABGEF1Q9UJ41 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RABGEF1Q9UJ41 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RABGEF1Q9UJ41 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RABGEF1Q9UJ41 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RABGEF1Q9UJ41 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RABGEF1Q9UJ41 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RABGEF1Q9UJ41 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RABGEF1Q9UJ41 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RABGEF1Q9UJ41 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RABGEF1Q9UJ41 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RABGEF1Q9UJ41 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RABGEF1Q9UJ41 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RABGEF1Q9UJ41 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RABGEF1Q9UJ41 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RABGEF1Q9UJ41 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RABGEF1Q9UJ41 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RABGEF1Q9UJ41 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RABGEF1Q9UJ41 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RABGEF1Q9UJ41 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RABGEF1Q9UJ41 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RABGEF1Q9UJ41 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RABGEF1Q9UJ41 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RABGEF1Q9UJ41 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RABGEF1Q9UJ41 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RABGEF1Q9UJ41 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RABGEF1Q9UJ41 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RABGEF1Q9UJ41 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RABGEF1Q9UJ41 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RABGEF1Q9UJ41 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RABGEF1Q9UJ41 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RABGEF1Q9UJ41 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RABGEF1Q9UJ41 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RABGEF1Q9UJ41 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RABGEF1Q9UJ41 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RABGEF1Q9UJ41 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RABGEF1Q9UJ41 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RABGEF1Q9UJ41 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RABGEF1Q9UJ41 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RABGEF1Q9UJ41 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RABGEF1Q9UJ41 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RABGEF1Q9UJ41 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RABGEF1Q9UJ41 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RABGEF1Q9UJ41 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RABGEF1Q9UJ41 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RABGEF1Q9UJ41 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RABGEF1Q9UJ41 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RABGEF1Q9UJ41 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RABGEF1Q9UJ41 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RABGEF1Q9UJ41 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RABGEF1Q9UJ41 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RABGEF1Q9UJ41 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RABGEF1Q9UJ41 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RABGEF1Q9UJ41 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RABGEF1Q9UJ41 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RABGEF1Q9UJ41 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RABGEF1Q9UJ41 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RABGEF1Q9UJ41 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RABGEF1Q9UJ41 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RABGEF1Q9UJ41 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
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