Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHB9

SRP68, Signal recognition particle subunit SRP68, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP68Q9UHB9 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
SRP68Q9UHB9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SRP68Q9UHB9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SRP68Q9UHB9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SRP68Q9UHB9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
SRP68Q9UHB9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SRP68Q9UHB9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SRP68Q9UHB9 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SRP68Q9UHB9 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
SRP68Q9UHB9 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SRP68Q9UHB9 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SRP68Q9UHB9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SRP68Q9UHB9 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
SRP68Q9UHB9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SRP68Q9UHB9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SRP68Q9UHB9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SRP68Q9UHB9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SRP68Q9UHB9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SRP68Q9UHB9 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SRP68Q9UHB9 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SRP68Q9UHB9 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SRP68Q9UHB9 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SRP68Q9UHB9 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SRP68Q9UHB9 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SRP68Q9UHB9 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SRP68Q9UHB9 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SRP68Q9UHB9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SRP68Q9UHB9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SRP68Q9UHB9 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SRP68Q9UHB9 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SRP68Q9UHB9 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
SRP68Q9UHB9 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SRP68Q9UHB9 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SRP68Q9UHB9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SRP68Q9UHB9 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SRP68Q9UHB9 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SRP68Q9UHB9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SRP68Q9UHB9 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SRP68Q9UHB9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SRP68Q9UHB9 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SRP68Q9UHB9 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
SRP68Q9UHB9 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SRP68Q9UHB9 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SRP68Q9UHB9 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SRP68Q9UHB9 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SRP68Q9UHB9 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SRP68Q9UHB9 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SRP68Q9UHB9 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SRP68Q9UHB9 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SRP68Q9UHB9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SRP68Q9UHB9 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SRP68Q9UHB9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SRP68Q9UHB9 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SRP68Q9UHB9 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SRP68Q9UHB9 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SRP68Q9UHB9 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SRP68Q9UHB9 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SRP68Q9UHB9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SRP68Q9UHB9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SRP68Q9UHB9 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SRP68Q9UHB9 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SRP68Q9UHB9 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SRP68Q9UHB9 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SRP68Q9UHB9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SRP68Q9UHB9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SRP68Q9UHB9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SRP68Q9UHB9 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SRP68Q9UHB9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SRP68Q9UHB9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SRP68Q9UHB9 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SRP68Q9UHB9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SRP68Q9UHB9 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SRP68Q9UHB9 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
SRP68Q9UHB9 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SRP68Q9UHB9 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SRP68Q9UHB9 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SRP68Q9UHB9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SRP68Q9UHB9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SRP68Q9UHB9 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SRP68Q9UHB9 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SRP68Q9UHB9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.08
SRP68Q9UHB9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SRP68Q9UHB9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SRP68Q9UHB9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SRP68Q9UHB9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SRP68Q9UHB9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SRP68Q9UHB9 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SRP68Q9UHB9 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SRP68Q9UHB9 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SRP68Q9UHB9 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SRP68Q9UHB9 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SRP68Q9UHB9 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SRP68Q9UHB9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SRP68Q9UHB9 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SRP68Q9UHB9 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SRP68Q9UHB9 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SRP68Q9UHB9 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SRP68Q9UHB9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SRP68Q9UHB9 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SRP68Q9UHB9 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms