Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ4

KRTAP9-2, Keratin-associated protein 9-2, humanhuman

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Length 174 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-2Q9BYQ4 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
KRTAP9-2Q9BYQ4 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
KRTAP9-2Q9BYQ4 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
KRTAP9-2Q9BYQ4 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
KRTAP9-2Q9BYQ4 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
KRTAP9-2Q9BYQ4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
KRTAP9-2Q9BYQ4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
KRTAP9-2Q9BYQ4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
KRTAP9-2Q9BYQ4 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
KRTAP9-2Q9BYQ4 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
KRTAP9-2Q9BYQ4 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
KRTAP9-2Q9BYQ4 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC027701.1-202ENST00000520988 459 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
KRTAP9-2Q9BYQ4 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
KRTAP9-2Q9BYQ4 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC108673.3-201ENST00000609183 335 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
KRTAP9-2Q9BYQ4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
KRTAP9-2Q9BYQ4 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
KRTAP9-2Q9BYQ4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
KRTAP9-2Q9BYQ4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
KRTAP9-2Q9BYQ4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
KRTAP9-2Q9BYQ4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
KRTAP9-2Q9BYQ4 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
KRTAP9-2Q9BYQ4 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
KRTAP9-2Q9BYQ4 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
KRTAP9-2Q9BYQ4 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
KRTAP9-2Q9BYQ4 FO393415.3-201ENST00000456424 375 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
KRTAP9-2Q9BYQ4 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
KRTAP9-2Q9BYQ4 PDC-202ENST00000497198 1174 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
KRTAP9-2Q9BYQ4 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
KRTAP9-2Q9BYQ4 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC083964.1-201ENST00000607549 630 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
KRTAP9-2Q9BYQ4 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
KRTAP9-2Q9BYQ4 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
KRTAP9-2Q9BYQ4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
KRTAP9-2Q9BYQ4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
KRTAP9-2Q9BYQ4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
KRTAP9-2Q9BYQ4 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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KRTAP9-2Q9BYQ4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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KRTAP9-2Q9BYQ4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
KRTAP9-2Q9BYQ4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
KRTAP9-2Q9BYQ4 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
KRTAP9-2Q9BYQ4 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
KRTAP9-2Q9BYQ4 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
KRTAP9-2Q9BYQ4 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
KRTAP9-2Q9BYQ4 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
KRTAP9-2Q9BYQ4 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
KRTAP9-2Q9BYQ4 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
KRTAP9-2Q9BYQ4 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
KRTAP9-2Q9BYQ4 PTP4A2-201ENST00000457805 1032 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
KRTAP9-2Q9BYQ4 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
KRTAP9-2Q9BYQ4 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC020611.2-201ENST00000535594 671 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
KRTAP9-2Q9BYQ4 C15orf40-209ENST00000538348 561 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
KRTAP9-2Q9BYQ4 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC11.05□□□□□ -0.64
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC087762.1-201ENST00000559755 643 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
KRTAP9-2Q9BYQ4 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
KRTAP9-2Q9BYQ4 AL133445.2-201ENST00000611191 527 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
KRTAP9-2Q9BYQ4 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC107068.2-201ENST00000634611 447 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
KRTAP9-2Q9BYQ4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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