Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUP0

EFHD1, EF-hand domain-containing protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD1Q9BUP0 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EFHD1Q9BUP0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EFHD1Q9BUP0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
EFHD1Q9BUP0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EFHD1Q9BUP0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EFHD1Q9BUP0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EFHD1Q9BUP0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EFHD1Q9BUP0 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EFHD1Q9BUP0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EFHD1Q9BUP0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EFHD1Q9BUP0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EFHD1Q9BUP0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EFHD1Q9BUP0 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EFHD1Q9BUP0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EFHD1Q9BUP0 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EFHD1Q9BUP0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EFHD1Q9BUP0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EFHD1Q9BUP0 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EFHD1Q9BUP0 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EFHD1Q9BUP0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EFHD1Q9BUP0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EFHD1Q9BUP0 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EFHD1Q9BUP0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EFHD1Q9BUP0 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EFHD1Q9BUP0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EFHD1Q9BUP0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EFHD1Q9BUP0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EFHD1Q9BUP0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EFHD1Q9BUP0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EFHD1Q9BUP0 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EFHD1Q9BUP0 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EFHD1Q9BUP0 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EFHD1Q9BUP0 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EFHD1Q9BUP0 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EFHD1Q9BUP0 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EFHD1Q9BUP0 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EFHD1Q9BUP0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EFHD1Q9BUP0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EFHD1Q9BUP0 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EFHD1Q9BUP0 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EFHD1Q9BUP0 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
EFHD1Q9BUP0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EFHD1Q9BUP0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EFHD1Q9BUP0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EFHD1Q9BUP0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EFHD1Q9BUP0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EFHD1Q9BUP0 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
EFHD1Q9BUP0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EFHD1Q9BUP0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EFHD1Q9BUP0 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
EFHD1Q9BUP0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EFHD1Q9BUP0 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
EFHD1Q9BUP0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EFHD1Q9BUP0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EFHD1Q9BUP0 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EFHD1Q9BUP0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EFHD1Q9BUP0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EFHD1Q9BUP0 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EFHD1Q9BUP0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EFHD1Q9BUP0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EFHD1Q9BUP0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EFHD1Q9BUP0 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EFHD1Q9BUP0 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EFHD1Q9BUP0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EFHD1Q9BUP0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
EFHD1Q9BUP0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EFHD1Q9BUP0 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EFHD1Q9BUP0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EFHD1Q9BUP0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EFHD1Q9BUP0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EFHD1Q9BUP0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EFHD1Q9BUP0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EFHD1Q9BUP0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EFHD1Q9BUP0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EFHD1Q9BUP0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EFHD1Q9BUP0 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EFHD1Q9BUP0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EFHD1Q9BUP0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EFHD1Q9BUP0 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EFHD1Q9BUP0 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EFHD1Q9BUP0 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EFHD1Q9BUP0 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EFHD1Q9BUP0 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EFHD1Q9BUP0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EFHD1Q9BUP0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EFHD1Q9BUP0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EFHD1Q9BUP0 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EFHD1Q9BUP0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EFHD1Q9BUP0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EFHD1Q9BUP0 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EFHD1Q9BUP0 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EFHD1Q9BUP0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EFHD1Q9BUP0 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
EFHD1Q9BUP0 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EFHD1Q9BUP0 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
EFHD1Q9BUP0 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EFHD1Q9BUP0 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EFHD1Q9BUP0 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EFHD1Q9BUP0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EFHD1Q9BUP0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms