Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EBF4Q9BQW3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EBF4Q9BQW3 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EBF4Q9BQW3 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EBF4Q9BQW3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EBF4Q9BQW3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
EBF4Q9BQW3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EBF4Q9BQW3 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EBF4Q9BQW3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EBF4Q9BQW3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EBF4Q9BQW3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EBF4Q9BQW3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EBF4Q9BQW3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EBF4Q9BQW3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
EBF4Q9BQW3 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EBF4Q9BQW3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EBF4Q9BQW3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EBF4Q9BQW3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EBF4Q9BQW3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EBF4Q9BQW3 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EBF4Q9BQW3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EBF4Q9BQW3 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EBF4Q9BQW3 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EBF4Q9BQW3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
EBF4Q9BQW3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EBF4Q9BQW3 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EBF4Q9BQW3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EBF4Q9BQW3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EBF4Q9BQW3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EBF4Q9BQW3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EBF4Q9BQW3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EBF4Q9BQW3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
EBF4Q9BQW3 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
EBF4Q9BQW3 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EBF4Q9BQW3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EBF4Q9BQW3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EBF4Q9BQW3 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EBF4Q9BQW3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EBF4Q9BQW3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EBF4Q9BQW3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EBF4Q9BQW3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EBF4Q9BQW3 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EBF4Q9BQW3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EBF4Q9BQW3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EBF4Q9BQW3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EBF4Q9BQW3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EBF4Q9BQW3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EBF4Q9BQW3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EBF4Q9BQW3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EBF4Q9BQW3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EBF4Q9BQW3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EBF4Q9BQW3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
EBF4Q9BQW3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EBF4Q9BQW3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EBF4Q9BQW3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EBF4Q9BQW3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EBF4Q9BQW3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EBF4Q9BQW3 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EBF4Q9BQW3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EBF4Q9BQW3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EBF4Q9BQW3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EBF4Q9BQW3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EBF4Q9BQW3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
EBF4Q9BQW3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EBF4Q9BQW3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
EBF4Q9BQW3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EBF4Q9BQW3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EBF4Q9BQW3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EBF4Q9BQW3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EBF4Q9BQW3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EBF4Q9BQW3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EBF4Q9BQW3 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EBF4Q9BQW3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EBF4Q9BQW3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EBF4Q9BQW3 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EBF4Q9BQW3 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EBF4Q9BQW3 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EBF4Q9BQW3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EBF4Q9BQW3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EBF4Q9BQW3 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EBF4Q9BQW3 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EBF4Q9BQW3 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EBF4Q9BQW3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EBF4Q9BQW3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
EBF4Q9BQW3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
EBF4Q9BQW3 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EBF4Q9BQW3 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EBF4Q9BQW3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EBF4Q9BQW3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EBF4Q9BQW3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EBF4Q9BQW3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EBF4Q9BQW3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EBF4Q9BQW3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EBF4Q9BQW3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EBF4Q9BQW3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EBF4Q9BQW3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EBF4Q9BQW3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EBF4Q9BQW3 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EBF4Q9BQW3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EBF4Q9BQW3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms