Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA3CQ99985 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA3CQ99985 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA3CQ99985 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA3CQ99985 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA3CQ99985 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA3CQ99985 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA3CQ99985 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA3CQ99985 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA3CQ99985 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA3CQ99985 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA3CQ99985 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA3CQ99985 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA3CQ99985 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA3CQ99985 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA3CQ99985 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA3CQ99985 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA3CQ99985 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA3CQ99985 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA3CQ99985 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA3CQ99985 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA3CQ99985 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA3CQ99985 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA3CQ99985 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA3CQ99985 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA3CQ99985 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA3CQ99985 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA3CQ99985 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA3CQ99985 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA3CQ99985 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA3CQ99985 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA3CQ99985 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA3CQ99985 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA3CQ99985 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA3CQ99985 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA3CQ99985 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA3CQ99985 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA3CQ99985 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA3CQ99985 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA3CQ99985 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA3CQ99985 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA3CQ99985 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA3CQ99985 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA3CQ99985 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA3CQ99985 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA3CQ99985 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA3CQ99985 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA3CQ99985 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA3CQ99985 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA3CQ99985 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA3CQ99985 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA3CQ99985 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA3CQ99985 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA3CQ99985 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA3CQ99985 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA3CQ99985 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA3CQ99985 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA3CQ99985 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA3CQ99985 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA3CQ99985 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA3CQ99985 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA3CQ99985 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA3CQ99985 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA3CQ99985 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA3CQ99985 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA3CQ99985 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA3CQ99985 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA3CQ99985 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA3CQ99985 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA3CQ99985 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA3CQ99985 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA3CQ99985 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA3CQ99985 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA3CQ99985 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA3CQ99985 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA3CQ99985 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA3CQ99985 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA3CQ99985 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA3CQ99985 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA3CQ99985 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA3CQ99985 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA3CQ99985 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA3CQ99985 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA3CQ99985 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMA3CQ99985 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA3CQ99985 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA3CQ99985 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA3CQ99985 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA3CQ99985 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA3CQ99985 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA3CQ99985 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA3CQ99985 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA3CQ99985 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMA3CQ99985 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA3CQ99985 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA3CQ99985 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA3CQ99985 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA3CQ99985 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA3CQ99985 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA3CQ99985 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms