Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4S0

CCDC82, Coiled-coil domain-containing protein 82, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82Q8N4S0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC82Q8N4S0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC82Q8N4S0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC82Q8N4S0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC82Q8N4S0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC82Q8N4S0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC82Q8N4S0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC82Q8N4S0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC82Q8N4S0 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC82Q8N4S0 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC82Q8N4S0 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC82Q8N4S0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC82Q8N4S0 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC82Q8N4S0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC82Q8N4S0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC82Q8N4S0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC82Q8N4S0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC82Q8N4S0 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC82Q8N4S0 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC82Q8N4S0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC82Q8N4S0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC82Q8N4S0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC82Q8N4S0 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC82Q8N4S0 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC82Q8N4S0 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC82Q8N4S0 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC82Q8N4S0 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC82Q8N4S0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC82Q8N4S0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC82Q8N4S0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC82Q8N4S0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC82Q8N4S0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC82Q8N4S0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC82Q8N4S0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC82Q8N4S0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC82Q8N4S0 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC82Q8N4S0 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC82Q8N4S0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC82Q8N4S0 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC82Q8N4S0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC82Q8N4S0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC82Q8N4S0 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC82Q8N4S0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC82Q8N4S0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC82Q8N4S0 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC82Q8N4S0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC82Q8N4S0 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC82Q8N4S0 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC82Q8N4S0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC82Q8N4S0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC82Q8N4S0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC82Q8N4S0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC82Q8N4S0 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC82Q8N4S0 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC82Q8N4S0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC82Q8N4S0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC82Q8N4S0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC82Q8N4S0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC82Q8N4S0 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC82Q8N4S0 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC82Q8N4S0 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC82Q8N4S0 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC82Q8N4S0 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC82Q8N4S0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC82Q8N4S0 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC82Q8N4S0 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC82Q8N4S0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC82Q8N4S0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC82Q8N4S0 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC82Q8N4S0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC82Q8N4S0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC82Q8N4S0 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC82Q8N4S0 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC82Q8N4S0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC82Q8N4S0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC82Q8N4S0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC82Q8N4S0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC82Q8N4S0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC82Q8N4S0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC82Q8N4S0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC82Q8N4S0 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC82Q8N4S0 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC82Q8N4S0 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC82Q8N4S0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC82Q8N4S0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC82Q8N4S0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC82Q8N4S0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC82Q8N4S0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC82Q8N4S0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC82Q8N4S0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC82Q8N4S0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC82Q8N4S0 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC82Q8N4S0 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC82Q8N4S0 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC82Q8N4S0 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC82Q8N4S0 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC82Q8N4S0 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC82Q8N4S0 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC82Q8N4S0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC82Q8N4S0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms