Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
WDR53Q7Z5U6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
WDR53Q7Z5U6 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
WDR53Q7Z5U6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
WDR53Q7Z5U6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
WDR53Q7Z5U6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
WDR53Q7Z5U6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
WDR53Q7Z5U6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
WDR53Q7Z5U6 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
WDR53Q7Z5U6 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
WDR53Q7Z5U6 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
WDR53Q7Z5U6 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
WDR53Q7Z5U6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
WDR53Q7Z5U6 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
WDR53Q7Z5U6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
WDR53Q7Z5U6 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
WDR53Q7Z5U6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
WDR53Q7Z5U6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
WDR53Q7Z5U6 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
WDR53Q7Z5U6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
WDR53Q7Z5U6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
WDR53Q7Z5U6 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
WDR53Q7Z5U6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
WDR53Q7Z5U6 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
WDR53Q7Z5U6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
WDR53Q7Z5U6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
WDR53Q7Z5U6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
WDR53Q7Z5U6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
WDR53Q7Z5U6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
WDR53Q7Z5U6 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
WDR53Q7Z5U6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
WDR53Q7Z5U6 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
WDR53Q7Z5U6 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
WDR53Q7Z5U6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
WDR53Q7Z5U6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
WDR53Q7Z5U6 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
WDR53Q7Z5U6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
WDR53Q7Z5U6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
WDR53Q7Z5U6 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
WDR53Q7Z5U6 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
WDR53Q7Z5U6 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
WDR53Q7Z5U6 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
WDR53Q7Z5U6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
WDR53Q7Z5U6 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
WDR53Q7Z5U6 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
WDR53Q7Z5U6 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
WDR53Q7Z5U6 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
WDR53Q7Z5U6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
WDR53Q7Z5U6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
WDR53Q7Z5U6 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
WDR53Q7Z5U6 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
WDR53Q7Z5U6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
WDR53Q7Z5U6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
WDR53Q7Z5U6 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
WDR53Q7Z5U6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
WDR53Q7Z5U6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
WDR53Q7Z5U6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
WDR53Q7Z5U6 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
WDR53Q7Z5U6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
WDR53Q7Z5U6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
WDR53Q7Z5U6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
WDR53Q7Z5U6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
WDR53Q7Z5U6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
WDR53Q7Z5U6 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
WDR53Q7Z5U6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
WDR53Q7Z5U6 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
WDR53Q7Z5U6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
WDR53Q7Z5U6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
WDR53Q7Z5U6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
WDR53Q7Z5U6 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
WDR53Q7Z5U6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
WDR53Q7Z5U6 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
WDR53Q7Z5U6 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
WDR53Q7Z5U6 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
WDR53Q7Z5U6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
WDR53Q7Z5U6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
WDR53Q7Z5U6 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
WDR53Q7Z5U6 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
WDR53Q7Z5U6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
WDR53Q7Z5U6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
WDR53Q7Z5U6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
WDR53Q7Z5U6 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
WDR53Q7Z5U6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
WDR53Q7Z5U6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
WDR53Q7Z5U6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
WDR53Q7Z5U6 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
WDR53Q7Z5U6 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
WDR53Q7Z5U6 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
WDR53Q7Z5U6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
WDR53Q7Z5U6 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
WDR53Q7Z5U6 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
WDR53Q7Z5U6 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
WDR53Q7Z5U6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
WDR53Q7Z5U6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
WDR53Q7Z5U6 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
WDR53Q7Z5U6 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
WDR53Q7Z5U6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
WDR53Q7Z5U6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
WDR53Q7Z5U6 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
WDR53Q7Z5U6 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.6 ms