Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ3

USP30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP30Q70CQ3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP30Q70CQ3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP30Q70CQ3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP30Q70CQ3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP30Q70CQ3 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP30Q70CQ3 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP30Q70CQ3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP30Q70CQ3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP30Q70CQ3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP30Q70CQ3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP30Q70CQ3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP30Q70CQ3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP30Q70CQ3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP30Q70CQ3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP30Q70CQ3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP30Q70CQ3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP30Q70CQ3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
USP30Q70CQ3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP30Q70CQ3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP30Q70CQ3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP30Q70CQ3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP30Q70CQ3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP30Q70CQ3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP30Q70CQ3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP30Q70CQ3 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP30Q70CQ3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP30Q70CQ3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP30Q70CQ3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP30Q70CQ3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
USP30Q70CQ3 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP30Q70CQ3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP30Q70CQ3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP30Q70CQ3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
USP30Q70CQ3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP30Q70CQ3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP30Q70CQ3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP30Q70CQ3 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP30Q70CQ3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP30Q70CQ3 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP30Q70CQ3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP30Q70CQ3 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP30Q70CQ3 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP30Q70CQ3 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP30Q70CQ3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP30Q70CQ3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP30Q70CQ3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP30Q70CQ3 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP30Q70CQ3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP30Q70CQ3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP30Q70CQ3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP30Q70CQ3 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP30Q70CQ3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP30Q70CQ3 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
USP30Q70CQ3 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP30Q70CQ3 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
USP30Q70CQ3 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
USP30Q70CQ3 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
USP30Q70CQ3 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
USP30Q70CQ3 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
USP30Q70CQ3 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
USP30Q70CQ3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP30Q70CQ3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP30Q70CQ3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP30Q70CQ3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP30Q70CQ3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP30Q70CQ3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP30Q70CQ3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
USP30Q70CQ3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP30Q70CQ3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP30Q70CQ3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP30Q70CQ3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
USP30Q70CQ3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP30Q70CQ3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP30Q70CQ3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP30Q70CQ3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP30Q70CQ3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP30Q70CQ3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP30Q70CQ3 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP30Q70CQ3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP30Q70CQ3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP30Q70CQ3 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP30Q70CQ3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP30Q70CQ3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP30Q70CQ3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP30Q70CQ3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP30Q70CQ3 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP30Q70CQ3 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
USP30Q70CQ3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP30Q70CQ3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP30Q70CQ3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP30Q70CQ3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP30Q70CQ3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP30Q70CQ3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP30Q70CQ3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP30Q70CQ3 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP30Q70CQ3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP30Q70CQ3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP30Q70CQ3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP30Q70CQ3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP30Q70CQ3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms