Protein–RNA interactions for Protein: Q6XD76

ASCL4, Achaete-scute homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL4Q6XD76 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ASCL4Q6XD76 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ASCL4Q6XD76 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ASCL4Q6XD76 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ASCL4Q6XD76 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ASCL4Q6XD76 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ASCL4Q6XD76 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ASCL4Q6XD76 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ASCL4Q6XD76 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ASCL4Q6XD76 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ASCL4Q6XD76 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ASCL4Q6XD76 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ASCL4Q6XD76 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ASCL4Q6XD76 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ASCL4Q6XD76 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ASCL4Q6XD76 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ASCL4Q6XD76 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ASCL4Q6XD76 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ASCL4Q6XD76 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ASCL4Q6XD76 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ASCL4Q6XD76 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ASCL4Q6XD76 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ASCL4Q6XD76 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ASCL4Q6XD76 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ASCL4Q6XD76 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ASCL4Q6XD76 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ASCL4Q6XD76 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ASCL4Q6XD76 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ASCL4Q6XD76 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ASCL4Q6XD76 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ASCL4Q6XD76 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ASCL4Q6XD76 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ASCL4Q6XD76 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ASCL4Q6XD76 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ASCL4Q6XD76 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ASCL4Q6XD76 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ASCL4Q6XD76 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ASCL4Q6XD76 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ASCL4Q6XD76 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ASCL4Q6XD76 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ASCL4Q6XD76 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ASCL4Q6XD76 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ASCL4Q6XD76 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ASCL4Q6XD76 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ASCL4Q6XD76 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ASCL4Q6XD76 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ASCL4Q6XD76 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ASCL4Q6XD76 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ASCL4Q6XD76 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ASCL4Q6XD76 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ASCL4Q6XD76 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ASCL4Q6XD76 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ASCL4Q6XD76 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ASCL4Q6XD76 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ASCL4Q6XD76 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ASCL4Q6XD76 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ASCL4Q6XD76 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ASCL4Q6XD76 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ASCL4Q6XD76 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ASCL4Q6XD76 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ASCL4Q6XD76 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ASCL4Q6XD76 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ASCL4Q6XD76 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ASCL4Q6XD76 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ASCL4Q6XD76 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ASCL4Q6XD76 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ASCL4Q6XD76 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ASCL4Q6XD76 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ASCL4Q6XD76 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ASCL4Q6XD76 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ASCL4Q6XD76 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ASCL4Q6XD76 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ASCL4Q6XD76 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ASCL4Q6XD76 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ASCL4Q6XD76 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ASCL4Q6XD76 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ASCL4Q6XD76 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ASCL4Q6XD76 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ASCL4Q6XD76 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ASCL4Q6XD76 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ASCL4Q6XD76 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ASCL4Q6XD76 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ASCL4Q6XD76 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ASCL4Q6XD76 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ASCL4Q6XD76 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ASCL4Q6XD76 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ASCL4Q6XD76 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ASCL4Q6XD76 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ASCL4Q6XD76 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ASCL4Q6XD76 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ASCL4Q6XD76 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ASCL4Q6XD76 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ASCL4Q6XD76 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ASCL4Q6XD76 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ASCL4Q6XD76 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ASCL4Q6XD76 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ASCL4Q6XD76 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ASCL4Q6XD76 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ASCL4Q6XD76 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ASCL4Q6XD76 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms