Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTE8

MRNIP, MRN complex-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRNIPQ6NTE8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRNIPQ6NTE8 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRNIPQ6NTE8 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRNIPQ6NTE8 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRNIPQ6NTE8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRNIPQ6NTE8 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MRNIPQ6NTE8 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MRNIPQ6NTE8 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MRNIPQ6NTE8 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MRNIPQ6NTE8 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MRNIPQ6NTE8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRNIPQ6NTE8 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MRNIPQ6NTE8 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRNIPQ6NTE8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRNIPQ6NTE8 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRNIPQ6NTE8 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRNIPQ6NTE8 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRNIPQ6NTE8 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRNIPQ6NTE8 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRNIPQ6NTE8 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRNIPQ6NTE8 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRNIPQ6NTE8 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRNIPQ6NTE8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRNIPQ6NTE8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRNIPQ6NTE8 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRNIPQ6NTE8 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRNIPQ6NTE8 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRNIPQ6NTE8 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MRNIPQ6NTE8 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MRNIPQ6NTE8 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MRNIPQ6NTE8 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRNIPQ6NTE8 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRNIPQ6NTE8 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRNIPQ6NTE8 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRNIPQ6NTE8 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRNIPQ6NTE8 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRNIPQ6NTE8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRNIPQ6NTE8 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRNIPQ6NTE8 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRNIPQ6NTE8 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRNIPQ6NTE8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRNIPQ6NTE8 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRNIPQ6NTE8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRNIPQ6NTE8 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRNIPQ6NTE8 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRNIPQ6NTE8 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRNIPQ6NTE8 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRNIPQ6NTE8 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRNIPQ6NTE8 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRNIPQ6NTE8 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRNIPQ6NTE8 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRNIPQ6NTE8 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRNIPQ6NTE8 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRNIPQ6NTE8 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MRNIPQ6NTE8 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRNIPQ6NTE8 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRNIPQ6NTE8 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRNIPQ6NTE8 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRNIPQ6NTE8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRNIPQ6NTE8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRNIPQ6NTE8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRNIPQ6NTE8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRNIPQ6NTE8 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRNIPQ6NTE8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRNIPQ6NTE8 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRNIPQ6NTE8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRNIPQ6NTE8 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRNIPQ6NTE8 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRNIPQ6NTE8 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRNIPQ6NTE8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRNIPQ6NTE8 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRNIPQ6NTE8 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRNIPQ6NTE8 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRNIPQ6NTE8 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRNIPQ6NTE8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRNIPQ6NTE8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRNIPQ6NTE8 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MRNIPQ6NTE8 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRNIPQ6NTE8 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRNIPQ6NTE8 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRNIPQ6NTE8 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRNIPQ6NTE8 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRNIPQ6NTE8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRNIPQ6NTE8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRNIPQ6NTE8 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRNIPQ6NTE8 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRNIPQ6NTE8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRNIPQ6NTE8 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
MRNIPQ6NTE8 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRNIPQ6NTE8 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRNIPQ6NTE8 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRNIPQ6NTE8 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRNIPQ6NTE8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRNIPQ6NTE8 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRNIPQ6NTE8 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MRNIPQ6NTE8 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MRNIPQ6NTE8 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22■■□□□ 1.11
MRNIPQ6NTE8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MRNIPQ6NTE8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MRNIPQ6NTE8 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.7 ms