Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ2

PHLDB3, Pleckstrin homology-like domain family B member 3, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHLDB3Q6NSJ2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PHLDB3Q6NSJ2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PHLDB3Q6NSJ2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PHLDB3Q6NSJ2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PHLDB3Q6NSJ2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PHLDB3Q6NSJ2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PHLDB3Q6NSJ2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PHLDB3Q6NSJ2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PHLDB3Q6NSJ2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PHLDB3Q6NSJ2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PHLDB3Q6NSJ2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PHLDB3Q6NSJ2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PHLDB3Q6NSJ2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PHLDB3Q6NSJ2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PHLDB3Q6NSJ2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PHLDB3Q6NSJ2 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PHLDB3Q6NSJ2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PHLDB3Q6NSJ2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PHLDB3Q6NSJ2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PHLDB3Q6NSJ2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PHLDB3Q6NSJ2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PHLDB3Q6NSJ2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PHLDB3Q6NSJ2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PHLDB3Q6NSJ2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PHLDB3Q6NSJ2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PHLDB3Q6NSJ2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PHLDB3Q6NSJ2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PHLDB3Q6NSJ2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PHLDB3Q6NSJ2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PHLDB3Q6NSJ2 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PHLDB3Q6NSJ2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PHLDB3Q6NSJ2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PHLDB3Q6NSJ2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PHLDB3Q6NSJ2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PHLDB3Q6NSJ2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PHLDB3Q6NSJ2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PHLDB3Q6NSJ2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PHLDB3Q6NSJ2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PHLDB3Q6NSJ2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PHLDB3Q6NSJ2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PHLDB3Q6NSJ2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PHLDB3Q6NSJ2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PHLDB3Q6NSJ2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PHLDB3Q6NSJ2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PHLDB3Q6NSJ2 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PHLDB3Q6NSJ2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PHLDB3Q6NSJ2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PHLDB3Q6NSJ2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PHLDB3Q6NSJ2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PHLDB3Q6NSJ2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PHLDB3Q6NSJ2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PHLDB3Q6NSJ2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PHLDB3Q6NSJ2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PHLDB3Q6NSJ2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PHLDB3Q6NSJ2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PHLDB3Q6NSJ2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PHLDB3Q6NSJ2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PHLDB3Q6NSJ2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PHLDB3Q6NSJ2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PHLDB3Q6NSJ2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PHLDB3Q6NSJ2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PHLDB3Q6NSJ2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PHLDB3Q6NSJ2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PHLDB3Q6NSJ2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PHLDB3Q6NSJ2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PHLDB3Q6NSJ2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PHLDB3Q6NSJ2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PHLDB3Q6NSJ2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PHLDB3Q6NSJ2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PHLDB3Q6NSJ2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PHLDB3Q6NSJ2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PHLDB3Q6NSJ2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PHLDB3Q6NSJ2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PHLDB3Q6NSJ2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PHLDB3Q6NSJ2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PHLDB3Q6NSJ2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PHLDB3Q6NSJ2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PHLDB3Q6NSJ2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PHLDB3Q6NSJ2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PHLDB3Q6NSJ2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PHLDB3Q6NSJ2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PHLDB3Q6NSJ2 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PHLDB3Q6NSJ2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PHLDB3Q6NSJ2 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PHLDB3Q6NSJ2 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PHLDB3Q6NSJ2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PHLDB3Q6NSJ2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PHLDB3Q6NSJ2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PHLDB3Q6NSJ2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PHLDB3Q6NSJ2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PHLDB3Q6NSJ2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PHLDB3Q6NSJ2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PHLDB3Q6NSJ2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PHLDB3Q6NSJ2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PHLDB3Q6NSJ2 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PHLDB3Q6NSJ2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PHLDB3Q6NSJ2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PHLDB3Q6NSJ2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PHLDB3Q6NSJ2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PHLDB3Q6NSJ2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms