Protein–RNA interactions for Protein: Q5JS37

NHLRC3, NHL repeat-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC3Q5JS37 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NHLRC3Q5JS37 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
NHLRC3Q5JS37 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC19■□□□□ 0.63
NHLRC3Q5JS37 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NHLRC3Q5JS37 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NHLRC3Q5JS37 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NHLRC3Q5JS37 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NHLRC3Q5JS37 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NHLRC3Q5JS37 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NHLRC3Q5JS37 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NHLRC3Q5JS37 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NHLRC3Q5JS37 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NHLRC3Q5JS37 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NHLRC3Q5JS37 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NHLRC3Q5JS37 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NHLRC3Q5JS37 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NHLRC3Q5JS37 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NHLRC3Q5JS37 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NHLRC3Q5JS37 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NHLRC3Q5JS37 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NHLRC3Q5JS37 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
NHLRC3Q5JS37 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NHLRC3Q5JS37 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NHLRC3Q5JS37 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NHLRC3Q5JS37 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NHLRC3Q5JS37 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NHLRC3Q5JS37 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NHLRC3Q5JS37 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NHLRC3Q5JS37 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NHLRC3Q5JS37 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NHLRC3Q5JS37 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NHLRC3Q5JS37 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NHLRC3Q5JS37 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NHLRC3Q5JS37 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NHLRC3Q5JS37 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NHLRC3Q5JS37 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NHLRC3Q5JS37 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
NHLRC3Q5JS37 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NHLRC3Q5JS37 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
NHLRC3Q5JS37 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NHLRC3Q5JS37 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
NHLRC3Q5JS37 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NHLRC3Q5JS37 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NHLRC3Q5JS37 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NHLRC3Q5JS37 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NHLRC3Q5JS37 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NHLRC3Q5JS37 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NHLRC3Q5JS37 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NHLRC3Q5JS37 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NHLRC3Q5JS37 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NHLRC3Q5JS37 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NHLRC3Q5JS37 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NHLRC3Q5JS37 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NHLRC3Q5JS37 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NHLRC3Q5JS37 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NHLRC3Q5JS37 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NHLRC3Q5JS37 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NHLRC3Q5JS37 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NHLRC3Q5JS37 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NHLRC3Q5JS37 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NHLRC3Q5JS37 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NHLRC3Q5JS37 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NHLRC3Q5JS37 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NHLRC3Q5JS37 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NHLRC3Q5JS37 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NHLRC3Q5JS37 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NHLRC3Q5JS37 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NHLRC3Q5JS37 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NHLRC3Q5JS37 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NHLRC3Q5JS37 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NHLRC3Q5JS37 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NHLRC3Q5JS37 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NHLRC3Q5JS37 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NHLRC3Q5JS37 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NHLRC3Q5JS37 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NHLRC3Q5JS37 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NHLRC3Q5JS37 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NHLRC3Q5JS37 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NHLRC3Q5JS37 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NHLRC3Q5JS37 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NHLRC3Q5JS37 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NHLRC3Q5JS37 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NHLRC3Q5JS37 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NHLRC3Q5JS37 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NHLRC3Q5JS37 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NHLRC3Q5JS37 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NHLRC3Q5JS37 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NHLRC3Q5JS37 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NHLRC3Q5JS37 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NHLRC3Q5JS37 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NHLRC3Q5JS37 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NHLRC3Q5JS37 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NHLRC3Q5JS37 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NHLRC3Q5JS37 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NHLRC3Q5JS37 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NHLRC3Q5JS37 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NHLRC3Q5JS37 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NHLRC3Q5JS37 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NHLRC3Q5JS37 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NHLRC3Q5JS37 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms