Protein–RNA interactions for Protein: Q13950

RUNX2, Runt-related transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX2Q13950 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RUNX2Q13950 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RUNX2Q13950 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RUNX2Q13950 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RUNX2Q13950 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RUNX2Q13950 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
RUNX2Q13950 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RUNX2Q13950 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RUNX2Q13950 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RUNX2Q13950 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RUNX2Q13950 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RUNX2Q13950 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RUNX2Q13950 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RUNX2Q13950 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RUNX2Q13950 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RUNX2Q13950 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RUNX2Q13950 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RUNX2Q13950 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RUNX2Q13950 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RUNX2Q13950 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RUNX2Q13950 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RUNX2Q13950 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RUNX2Q13950 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
RUNX2Q13950 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RUNX2Q13950 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RUNX2Q13950 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RUNX2Q13950 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RUNX2Q13950 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RUNX2Q13950 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RUNX2Q13950 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RUNX2Q13950 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RUNX2Q13950 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RUNX2Q13950 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
RUNX2Q13950 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RUNX2Q13950 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RUNX2Q13950 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RUNX2Q13950 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RUNX2Q13950 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RUNX2Q13950 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RUNX2Q13950 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RUNX2Q13950 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RUNX2Q13950 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RUNX2Q13950 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RUNX2Q13950 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RUNX2Q13950 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RUNX2Q13950 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RUNX2Q13950 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RUNX2Q13950 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RUNX2Q13950 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RUNX2Q13950 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RUNX2Q13950 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RUNX2Q13950 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RUNX2Q13950 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RUNX2Q13950 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RUNX2Q13950 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
RUNX2Q13950 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RUNX2Q13950 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RUNX2Q13950 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RUNX2Q13950 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RUNX2Q13950 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RUNX2Q13950 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RUNX2Q13950 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RUNX2Q13950 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RUNX2Q13950 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RUNX2Q13950 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RUNX2Q13950 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
RUNX2Q13950 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
RUNX2Q13950 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RUNX2Q13950 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RUNX2Q13950 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
RUNX2Q13950 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.94
RUNX2Q13950 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
RUNX2Q13950 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
RUNX2Q13950 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
RUNX2Q13950 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
RUNX2Q13950 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
RUNX2Q13950 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
RUNX2Q13950 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RUNX2Q13950 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RUNX2Q13950 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RUNX2Q13950 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RUNX2Q13950 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RUNX2Q13950 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RUNX2Q13950 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RUNX2Q13950 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RUNX2Q13950 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RUNX2Q13950 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
RUNX2Q13950 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RUNX2Q13950 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RUNX2Q13950 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RUNX2Q13950 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RUNX2Q13950 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RUNX2Q13950 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
RUNX2Q13950 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RUNX2Q13950 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RUNX2Q13950 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RUNX2Q13950 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RUNX2Q13950 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RUNX2Q13950 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RUNX2Q13950 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
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