Protein–RNA interactions for Protein: Q13487

SNAPC2, snRNA-activating protein complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC2Q13487 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNAPC2Q13487 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNAPC2Q13487 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNAPC2Q13487 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNAPC2Q13487 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNAPC2Q13487 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SNAPC2Q13487 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNAPC2Q13487 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNAPC2Q13487 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNAPC2Q13487 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNAPC2Q13487 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNAPC2Q13487 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SNAPC2Q13487 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SNAPC2Q13487 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNAPC2Q13487 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNAPC2Q13487 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNAPC2Q13487 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNAPC2Q13487 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNAPC2Q13487 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNAPC2Q13487 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNAPC2Q13487 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNAPC2Q13487 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SNAPC2Q13487 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNAPC2Q13487 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNAPC2Q13487 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNAPC2Q13487 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNAPC2Q13487 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNAPC2Q13487 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNAPC2Q13487 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNAPC2Q13487 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNAPC2Q13487 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNAPC2Q13487 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNAPC2Q13487 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNAPC2Q13487 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNAPC2Q13487 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SNAPC2Q13487 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SNAPC2Q13487 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SNAPC2Q13487 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SNAPC2Q13487 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SNAPC2Q13487 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SNAPC2Q13487 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SNAPC2Q13487 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SNAPC2Q13487 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SNAPC2Q13487 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SNAPC2Q13487 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SNAPC2Q13487 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SNAPC2Q13487 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SNAPC2Q13487 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SNAPC2Q13487 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SNAPC2Q13487 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNAPC2Q13487 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNAPC2Q13487 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNAPC2Q13487 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNAPC2Q13487 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SNAPC2Q13487 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNAPC2Q13487 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNAPC2Q13487 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNAPC2Q13487 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNAPC2Q13487 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SNAPC2Q13487 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SNAPC2Q13487 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SNAPC2Q13487 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SNAPC2Q13487 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SNAPC2Q13487 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SNAPC2Q13487 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SNAPC2Q13487 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SNAPC2Q13487 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SNAPC2Q13487 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SNAPC2Q13487 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SNAPC2Q13487 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SNAPC2Q13487 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SNAPC2Q13487 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SNAPC2Q13487 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SNAPC2Q13487 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SNAPC2Q13487 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SNAPC2Q13487 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNAPC2Q13487 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNAPC2Q13487 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNAPC2Q13487 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNAPC2Q13487 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SNAPC2Q13487 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNAPC2Q13487 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNAPC2Q13487 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNAPC2Q13487 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SNAPC2Q13487 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNAPC2Q13487 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNAPC2Q13487 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNAPC2Q13487 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNAPC2Q13487 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNAPC2Q13487 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNAPC2Q13487 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNAPC2Q13487 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNAPC2Q13487 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNAPC2Q13487 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNAPC2Q13487 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNAPC2Q13487 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNAPC2Q13487 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNAPC2Q13487 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNAPC2Q13487 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SNAPC2Q13487 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms