Protein–RNA interactions for Protein: Q13242

SRSF9, Serine/arginine-rich splicing factor 9, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF9Q13242 EGLN3-208ENST00000551935 575 ntTSL 49.07□□□□□ -0.962e-6■□□□□ 9.7
SRSF9Q13242 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.258e-14■□□□□ 9.7
SRSF9Q13242 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.138e-14■□□□□ 9.7
SRSF9Q13242 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.098e-14■□□□□ 9.7
SRSF9Q13242 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.078e-14■□□□□ 9.7
SRSF9Q13242 MAP4K4-201ENST00000302217 6624 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.158e-14■□□□□ 9.7
SRSF9Q13242 MAP4K4-206ENST00000413150 6958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.178e-14■□□□□ 9.7
SRSF9Q13242 MAP4K4-213ENST00000476609 3598 ntTSL 27.63□□□□□ -1.198e-14■□□□□ 9.7
SRSF9Q13242 MAP4K4-219ENST00000625522 7458 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.278e-14■□□□□ 9.7
SRSF9Q13242 MAP4K4-220ENST00000627726 3135 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.328e-14■□□□□ 9.7
SRSF9Q13242 MAP4K4-212ENST00000456652 3855 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.368e-14■□□□□ 9.7
SRSF9Q13242 MAP4K4-208ENST00000418101 776 ntTSL 36.35□□□□□ -1.398e-14■□□□□ 9.7
SRSF9Q13242 MAP4K4-209ENST00000421882 3416 ntTSL 56.27□□□□□ -1.418e-14■□□□□ 9.7
SRSF9Q13242 MAP4K4-203ENST00000347699 3792 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.428e-14■□□□□ 9.7
SRSF9Q13242 MAP4K4-221ENST00000634702 3800 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.458e-14■□□□□ 9.7
SRSF9Q13242 MAP4K4-207ENST00000417294 4251 ntTSL 54.69□□□□□ -1.668e-14■□□□□ 9.7
SRSF9Q13242 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.013e-9■□□□□ 9.7
SRSF9Q13242 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.173e-9■□□□□ 9.7
SRSF9Q13242 ACADVL-201ENST00000322910 2352 ntTSL 213.18□□□□□ -0.33e-9■□□□□ 9.7
SRSF9Q13242 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.323e-9■□□□□ 9.7
SRSF9Q13242 ACADVL-236ENST00000583850 903 ntTSL 211.8□□□□□ -0.523e-9■□□□□ 9.7
SRSF9Q13242 ACADVL-237ENST00000583858 1015 ntTSL 511.39□□□□□ -0.593e-9■□□□□ 9.7
SRSF9Q13242 ACADVL-214ENST00000578711 1732 nt11.34□□□□□ -0.593e-9■□□□□ 9.7
SRSF9Q13242 ACADVL-220ENST00000579546 582 ntTSL 511.11□□□□□ -0.633e-9■□□□□ 9.7
SRSF9Q13242 ACADVL-204ENST00000542255 1016 ntTSL 510.37□□□□□ -0.753e-9■□□□□ 9.7
SRSF9Q13242 ACADVL-239ENST00000585203 947 ntTSL 59.3□□□□□ -0.923e-9■□□□□ 9.7
SRSF9Q13242 ACADVL-219ENST00000579425 1234 ntTSL 59.3□□□□□ -0.923e-9■□□□□ 9.7
SRSF9Q13242 ACADVL-216ENST00000578824 720 ntTSL 26.51□□□□□ -1.373e-9■□□□□ 9.7
SRSF9Q13242 ACADVL-213ENST00000578579 458 ntTSL 33.72□□□□□ -1.813e-9■□□□□ 9.7
SRSF9Q13242 C20orf204-203ENST00000444463 4303 ntTSL 1 (best)13.16□□□□□ -0.32e-12■□□□□ 9.7
SRSF9Q13242 C20orf204-202ENST00000431158 2954 ntTSL 1 (best)12.91□□□□□ -0.342e-12■□□□□ 9.7
SRSF9Q13242 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.452e-12■□□□□ 9.7
SRSF9Q13242 EPS8L2-213ENST00000529346 1718 ntTSL 214.78□□□□□ -0.041e-9■□□□□ 9.7
SRSF9Q13242 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.291e-9■□□□□ 9.7
SRSF9Q13242 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.451e-9■□□□□ 9.7
SRSF9Q13242 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.461e-9■□□□□ 9.7
SRSF9Q13242 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.491e-9■□□□□ 9.7
SRSF9Q13242 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.511e-9■□□□□ 9.7
SRSF9Q13242 EPS8L2-208ENST00000526909 3844 ntTSL 59.35□□□□□ -0.911e-9■□□□□ 9.7
SRSF9Q13242 SRSF6-202ENST00000483871 1680 ntTSL 28.86□□□□□ -0.991e-15■□□□□ 9.6
SRSF9Q13242 SRSF6-201ENST00000244020 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.141e-15■□□□□ 9.6
SRSF9Q13242 ACADVL-232ENST00000583074 410 ntTSL 511.31□□□□□ -0.63e-9■□□□□ 9.6
SRSF9Q13242 TAF1C-215ENST00000566183 290 ntTSL 310.44□□□□□ -0.743e-9■□□□□ 9.6
SRSF9Q13242 TAF1C-210ENST00000564345 602 ntAPPRIS ALT2 TSL 410.06□□□□□ -0.83e-9■□□□□ 9.6
SRSF9Q13242 TAF1C-211ENST00000564454 555 ntAPPRIS ALT2 TSL 49.28□□□□□ -0.923e-9■□□□□ 9.6
SRSF9Q13242 TAF1C-221ENST00000569609 555 ntTSL 49.26□□□□□ -0.933e-9■□□□□ 9.6
SRSF9Q13242 TIMM10B-202ENST00000528908 593 ntTSL 1 (best)9.18□□□□□ -0.943e-9■□□□□ 9.6
SRSF9Q13242 TIMM10B-201ENST00000254616 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.063e-9■□□□□ 9.6
SRSF9Q13242 TIMM10B-203ENST00000530751 809 ntTSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.183e-9■□□□□ 9.6
SRSF9Q13242 AC084337.2-202ENST00000640959 595 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC7.08□□□□□ -1.283e-9■□□□□ 9.6
SRSF9Q13242 TIMM10B-205ENST00000533379 608 ntTSL 27.05□□□□□ -1.283e-9■□□□□ 9.6
SRSF9Q13242 AC084337.2-201ENST00000639224 589 ntAPPRIS ALT2 TSL 46.68□□□□□ -1.343e-9■□□□□ 9.6
SRSF9Q13242 TIMM10B-204ENST00000531462 516 ntTSL 36.03□□□□□ -1.443e-9■□□□□ 9.6
SRSF9Q13242 ASPSCR1-220ENST00000585140 447 ntTSL 311.49□□□□□ -0.571e-14■□□□□ 9.6
SRSF9Q13242 SAT2-214ENST00000576846 1563 nt15.69■□□□□ 0.15e-7■□□□□ 9.5
SRSF9Q13242 TKFC-210ENST00000529479 1781 ntTSL 1 (best)14.13□□□□□ -0.155e-7■□□□□ 9.5
SRSF9Q13242 SAT2-210ENST00000575114 803 ntTSL 213.59□□□□□ -0.235e-7■□□□□ 9.5
SRSF9Q13242 SAT2-209ENST00000573930 711 ntTSL 313.1□□□□□ -0.315e-7■□□□□ 9.5
SRSF9Q13242 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC12.66□□□□□ -0.385e-7■□□□□ 9.5
SRSF9Q13242 SLC2A1-202ENST00000415851 578 ntTSL 211.75□□□□□ -0.535e-7■□□□□ 9.5
SRSF9Q13242 PHYKPL-213ENST00000506001 583 ntTSL 311.73□□□□□ -0.535e-7■□□□□ 9.5
SRSF9Q13242 TKFC-206ENST00000525366 916 ntTSL 211.55□□□□□ -0.565e-7■□□□□ 9.5
SRSF9Q13242 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.585e-7■□□□□ 9.5
SRSF9Q13242 TKFC-202ENST00000524440 496 ntTSL 211.37□□□□□ -0.595e-7■□□□□ 9.5
SRSF9Q13242 SLC2A1-208ENST00000630287 2398 ntTSL 511.28□□□□□ -0.65e-7■□□□□ 9.5
SRSF9Q13242 SLC2A1-206ENST00000625233 1031 ntTSL 211.02□□□□□ -0.655e-7■□□□□ 9.5
SRSF9Q13242 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.655e-7■□□□□ 9.5
SRSF9Q13242 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.715e-7■□□□□ 9.5
SRSF9Q13242 CCDC57-202ENST00000389641 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.745e-7■□□□□ 9.5
SRSF9Q13242 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.745e-7■□□□□ 9.5
SRSF9Q13242 CCDC57-213ENST00000581625 491 ntTSL 59.82□□□□□ -0.845e-7■□□□□ 9.5
SRSF9Q13242 SLC2A1-201ENST00000372500 533 ntTSL 39.81□□□□□ -0.845e-7■□□□□ 9.5
SRSF9Q13242 SLC2A1-203ENST00000426263 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.865e-7■□□□□ 9.5
SRSF9Q13242 SAT2-202ENST00000380466 974 ntTSL 1 (best)9.18□□□□□ -0.945e-7■□□□□ 9.5
SRSF9Q13242 CCDC57-212ENST00000578910 796 ntTSL 59.03□□□□□ -0.965e-7■□□□□ 9.5
SRSF9Q13242 SLC2A1-209ENST00000630821 591 ntTSL 28.84□□□□□ -0.995e-7■□□□□ 9.5
SRSF9Q13242 PHYKPL-208ENST00000481811 2709 ntTSL 28.58□□□□□ -1.045e-7■□□□□ 9.5
SRSF9Q13242 SAT2-213ENST00000576686 582 ntTSL 28.48□□□□□ -1.055e-7■□□□□ 9.5
SRSF9Q13242 SAT2-206ENST00000571195 814 ntTSL 28.33□□□□□ -1.085e-7■□□□□ 9.5
SRSF9Q13242 MST1L-205ENST00000624762 3995 ntTSL 58.24□□□□□ -1.095e-7■□□□□ 9.5
SRSF9Q13242 TKFC-219ENST00000534084 964 ntTSL 38.23□□□□□ -1.095e-7■□□□□ 9.5
SRSF9Q13242 CCDC57-211ENST00000578187 696 ntTSL 27.83□□□□□ -1.165e-7■□□□□ 9.5
SRSF9Q13242 TKFC-213ENST00000530329 483 ntTSL 37.5□□□□□ -1.215e-7■□□□□ 9.5
SRSF9Q13242 SAT2-205ENST00000571074 860 ntTSL 27.5□□□□□ -1.215e-7■□□□□ 9.5
SRSF9Q13242 SAT2-207ENST00000572224 669 ntTSL 37.5□□□□□ -1.215e-7■□□□□ 9.5
SRSF9Q13242 PHYKPL-218ENST00000514424 584 ntTSL 47.43□□□□□ -1.225e-7■□□□□ 9.5
SRSF9Q13242 SAT2-211ENST00000575826 838 ntTSL 37.11□□□□□ -1.275e-7■□□□□ 9.5
SRSF9Q13242 SAT2-208ENST00000573566 640 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.285e-7■□□□□ 9.5
SRSF9Q13242 PHYKPL-216ENST00000510991 814 ntTSL 36.93□□□□□ -1.35e-7■□□□□ 9.5
SRSF9Q13242 SAT2-201ENST00000269298 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.415e-7■□□□□ 9.5
SRSF9Q13242 RPL31-203ENST00000409028 1110 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.445e-7■□□□□ 9.5
SRSF9Q13242 RPL31-210ENST00000441435 717 ntTSL 25.59□□□□□ -1.515e-7■□□□□ 9.5
SRSF9Q13242 PHYKPL-215ENST00000510913 643 ntTSL 35.51□□□□□ -1.535e-7■□□□□ 9.5
SRSF9Q13242 SAT2-203ENST00000570850 685 ntTSL 35.48□□□□□ -1.535e-7■□□□□ 9.5
SRSF9Q13242 RPL31-206ENST00000409650 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.675e-7■□□□□ 9.5
SRSF9Q13242 RPL31-204ENST00000409038 817 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.855e-7■□□□□ 9.5
SRSF9Q13242 PHKA2-202ENST00000464455 500 ntTSL 32.75□□□□□ -1.975e-7■□□□□ 9.5
SRSF9Q13242 CLUHP3-206ENST00000562354 4117 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.232e-7■□□□□ 9.5
SRSF9Q13242 CLUHP3-207ENST00000563678 1303 ntBASIC7.25□□□□□ -1.252e-7■□□□□ 9.5
SRSF9Q13242 PVT1-203ENST00000513868 1699 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.021e-7■□□□□ 9.5
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