RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566183.1

TAF1C-215, Transcript of TATA-box binding protein associated factor, RNA polymerase I subunit C, human

TSL 3

Gene TAF1C, Length 290 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TAF1C-215	ENST00000566183	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		41.37	■■■■■ 4.21
TAF1C-215	ENST00000566183	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		36.84	■■■■□ 3.49
TAF1C-215	ENST00000566183	ABCC9	O60706	1549 aa		36.13	■■■■□ 3.37
TAF1C-215	ENST00000566183	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		34.55	■■■■□ 3.12
TAF1C-215	ENST00000566183	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	34.53	■■■■□ 3.12
TAF1C-215	ENST00000566183	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		34.52	■■■■□ 3.12
TAF1C-215	ENST00000566183	NACAD	O15069	1562 aa		34.5	■■■■□ 3.11
TAF1C-215	ENST00000566183	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		34.3	■■■■□ 3.08
TAF1C-215	ENST00000566183	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		34.23	■■■■□ 3.07
TAF1C-215	ENST00000566183	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		33.86	■■■■□ 3.01
TAF1C-215	ENST00000566183	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	33.8	■■■■□ 3
TAF1C-215	ENST00000566183	SCRIB	Q14160	1630 aa		33.63	■■■□□ 2.97
TAF1C-215	ENST00000566183	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		33.58	■■■□□ 2.97
TAF1C-215	ENST00000566183	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		33.55	■■■□□ 2.96
TAF1C-215	ENST00000566183	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		33.14	■■■□□ 2.9
TAF1C-215	ENST00000566183	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	32.67	■■■□□ 2.82
TAF1C-215	ENST00000566183	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		32.62	■■■□□ 2.81
TAF1C-215	ENST00000566183	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		32.48	■■■□□ 2.79
TAF1C-215	ENST00000566183	SMARCA4	P51532	1647 aa		32.15	■■■□□ 2.74
TAF1C-215	ENST00000566183	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	32.09	■■■□□ 2.73
TAF1C-215	ENST00000566183	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		31.9	■■■□□ 2.7
TAF1C-215	ENST00000566183	SMARCA2	P51531	1590 aa		31.87	■■■□□ 2.69
TAF1C-215	ENST00000566183	NCAPD3	P42695	1498 aa		31.85	■■■□□ 2.69
TAF1C-215	ENST00000566183	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		31.84	■■■□□ 2.69
TAF1C-215	ENST00000566183	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		31.78	■■■□□ 2.68
TAF1C-215	ENST00000566183	HMGXB3	Q12766	1538 aa		31.74	■■■□□ 2.67
TAF1C-215	ENST00000566183	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	31.65	■■■□□ 2.66
TAF1C-215	ENST00000566183	WIZ	O95785	1651 aa		31.62	■■■□□ 2.65
TAF1C-215	ENST00000566183	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	31.53	■■■□□ 2.64
TAF1C-215	ENST00000566183	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	31.29	■■■□□ 2.6
TAF1C-215	ENST00000566183	NES	P48681	1621 aa		31.18	■■■□□ 2.58
TAF1C-215	ENST00000566183	ERCC6	Q03468	1493 aa		31.12	■■■□□ 2.57
TAF1C-215	ENST00000566183	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		31	■■■□□ 2.55
TAF1C-215	ENST00000566183	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		30.92	■■■□□ 2.54
TAF1C-215	ENST00000566183	CUX2	O14529	1486 aa		30.89	■■■□□ 2.54
TAF1C-215	ENST00000566183	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		30.84	■■■□□ 2.53
TAF1C-215	ENST00000566183	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		30.83	■■■□□ 2.53
TAF1C-215	ENST00000566183	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	30.81	■■■□□ 2.52
TAF1C-215	ENST00000566183	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		30.79	■■■□□ 2.52
TAF1C-215	ENST00000566183	CFTR	P13569	1480 aa		30.72	■■■□□ 2.51
TAF1C-215	ENST00000566183	PRDM2	Q13029	1718 aa		30.71	■■■□□ 2.51
TAF1C-215	ENST00000566183	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	30.68	■■■□□ 2.5
TAF1C-215	ENST00000566183	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		30.56	■■■□□ 2.48
TAF1C-215	ENST00000566183	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		30.54	■■■□□ 2.48
TAF1C-215	ENST00000566183	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		30.51	■■■□□ 2.48
TAF1C-215	ENST00000566183	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		30.44	■■■□□ 2.46
TAF1C-215	ENST00000566183	WDR62	O43379	1518 aa		30.41	■■■□□ 2.46
TAF1C-215	ENST00000566183	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	30.27	■■■□□ 2.44
TAF1C-215	ENST00000566183	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		30.11	■■■□□ 2.41
TAF1C-215	ENST00000566183	TOPBP1	Q92547	1522 aa		30.1	■■■□□ 2.41
TAF1C-215	ENST00000566183	ABCC8	Q09428	1581 aa		30.05	■■■□□ 2.4
TAF1C-215	ENST00000566183	CUX1	P39880	1505 aa		29.94	■■■□□ 2.38
TAF1C-215	ENST00000566183	IFT140	Q96RY7	1462 aa		29.88	■■■□□ 2.37
TAF1C-215	ENST00000566183	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	29.86	■■■□□ 2.37
TAF1C-215	ENST00000566183	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		29.82	■■■□□ 2.36
TAF1C-215	ENST00000566183	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	29.81	■■■□□ 2.36
TAF1C-215	ENST00000566183	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	29.79	■■■□□ 2.36
TAF1C-215	ENST00000566183	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		29.77	■■■□□ 2.36
TAF1C-215	ENST00000566183	SYNJ1	O43426	1573 aa		29.77	■■■□□ 2.36
TAF1C-215	ENST00000566183	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	29.76	■■■□□ 2.35
TAF1C-215	ENST00000566183	TOP2B	Q02880	1626 aa		29.74	■■■□□ 2.35
TAF1C-215	ENST00000566183	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	29.72	■■■□□ 2.35
TAF1C-215	ENST00000566183	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		29.7	■■■□□ 2.35
TAF1C-215	ENST00000566183	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		29.68	■■■□□ 2.34
TAF1C-215	ENST00000566183	WDR97	A6NE52	1622 aa		29.67	■■■□□ 2.34
TAF1C-215	ENST00000566183	SOGA1	O94964	1423 aa		29.66	■■■□□ 2.34
TAF1C-215	ENST00000566183	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	29.63	■■■□□ 2.33
TAF1C-215	ENST00000566183	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	29.54	■■■□□ 2.32
TAF1C-215	ENST00000566183	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		29.5	■■■□□ 2.31
TAF1C-215	ENST00000566183	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		29.46	■■■□□ 2.31
TAF1C-215	ENST00000566183	PBRM1	Q86U86	1689 aa		29.45	■■■□□ 2.31
TAF1C-215	ENST00000566183	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		29.37	■■■□□ 2.29
TAF1C-215	ENST00000566183	FBLN2	P98095	1184 aa		29.36	■■■□□ 2.29
TAF1C-215	ENST00000566183	GRIN2B	Q13224	1484 aa		29.35	■■■□□ 2.29
TAF1C-215	ENST00000566183	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		29.34	■■■□□ 2.29
TAF1C-215	ENST00000566183	CHD1	O14646	1710 aa		29.34	■■■□□ 2.29
TAF1C-215	ENST00000566183	TRIM41	Q8WV44	630 aa		29.28	■■■□□ 2.28
TAF1C-215	ENST00000566183	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	29.28	■■■□□ 2.28
TAF1C-215	ENST00000566183	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	29.22	■■■□□ 2.27
TAF1C-215	ENST00000566183	ADAMTS12	P58397	1594 aa		29.18	■■■□□ 2.26
TAF1C-215	ENST00000566183	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		29.17	■■■□□ 2.26
TAF1C-215	ENST00000566183	SYNJ2	O15056	1496 aa		29.16	■■■□□ 2.26
TAF1C-215	ENST00000566183	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		29.12	■■■□□ 2.25
TAF1C-215	ENST00000566183	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		29.12	■■■□□ 2.25
TAF1C-215	ENST00000566183	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		29.12	■■■□□ 2.25
TAF1C-215	ENST00000566183	KIF27	Q86VH2	1401 aa		29.11	■■■□□ 2.25
TAF1C-215	ENST00000566183	ARHGEF11	O15085	1522 aa		29.1	■■■□□ 2.25
TAF1C-215	ENST00000566183	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		29.02	■■■□□ 2.24
TAF1C-215	ENST00000566183	CUL7	Q14999	1698 aa		29.01	■■■□□ 2.23
TAF1C-215	ENST00000566183	GRIN2A	Q12879	1464 aa		29	■■■□□ 2.23
TAF1C-215	ENST00000566183	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		28.98	■■■□□ 2.23
TAF1C-215	ENST00000566183	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		28.96	■■■□□ 2.23
TAF1C-215	ENST00000566183	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		28.89	■■■□□ 2.22
TAF1C-215	ENST00000566183	IGF1R	P08069	1367 aa		28.89	■■■□□ 2.22
TAF1C-215	ENST00000566183	CEP170	Q5SW79	1584 aa		28.89	■■■□□ 2.22
TAF1C-215	ENST00000566183	ARAP1	Q96P48	1450 aa		28.85	■■■□□ 2.21
TAF1C-215	ENST00000566183	NUP160	Q12769	1436 aa		28.83	■■■□□ 2.21
TAF1C-215	ENST00000566183	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		28.79	■■■□□ 2.2
TAF1C-215	ENST00000566183	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		28.76	■■■□□ 2.2
TAF1C-215	ENST00000566183	SHROOM2	Q13796	1616 aa		28.68	■■■□□ 2.18

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