Protein–RNA interactions for Protein: P50991

CCT4, T-complex protein 1 subunit delta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT4P50991 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCT4P50991 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCT4P50991 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CCT4P50991 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCT4P50991 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCT4P50991 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCT4P50991 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCT4P50991 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCT4P50991 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCT4P50991 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCT4P50991 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCT4P50991 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCT4P50991 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCT4P50991 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCT4P50991 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCT4P50991 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CCT4P50991 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCT4P50991 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCT4P50991 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCT4P50991 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCT4P50991 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCT4P50991 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCT4P50991 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CCT4P50991 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCT4P50991 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCT4P50991 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCT4P50991 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCT4P50991 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCT4P50991 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCT4P50991 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCT4P50991 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCT4P50991 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCT4P50991 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCT4P50991 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCT4P50991 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCT4P50991 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCT4P50991 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCT4P50991 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCT4P50991 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCT4P50991 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCT4P50991 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCT4P50991 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCT4P50991 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCT4P50991 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCT4P50991 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCT4P50991 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCT4P50991 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCT4P50991 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCT4P50991 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCT4P50991 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCT4P50991 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCT4P50991 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCT4P50991 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCT4P50991 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CCT4P50991 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCT4P50991 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CCT4P50991 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CCT4P50991 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CCT4P50991 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCT4P50991 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCT4P50991 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CCT4P50991 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCT4P50991 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCT4P50991 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCT4P50991 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCT4P50991 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCT4P50991 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCT4P50991 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCT4P50991 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCT4P50991 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCT4P50991 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCT4P50991 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCT4P50991 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCT4P50991 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CCT4P50991 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCT4P50991 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCT4P50991 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCT4P50991 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCT4P50991 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCT4P50991 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCT4P50991 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCT4P50991 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CCT4P50991 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCT4P50991 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCT4P50991 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CCT4P50991 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCT4P50991 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCT4P50991 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCT4P50991 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCT4P50991 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCT4P50991 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCT4P50991 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCT4P50991 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCT4P50991 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCT4P50991 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCT4P50991 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCT4P50991 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCT4P50991 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCT4P50991 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCT4P50991 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms