Protein–RNA interactions for Protein: P48553

TRAPPC10, Trafficking protein particle complex subunit 10, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10P48553 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TRAPPC10P48553 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TRAPPC10P48553 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRAPPC10P48553 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TRAPPC10P48553 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TRAPPC10P48553 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRAPPC10P48553 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRAPPC10P48553 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRAPPC10P48553 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRAPPC10P48553 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRAPPC10P48553 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRAPPC10P48553 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRAPPC10P48553 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRAPPC10P48553 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRAPPC10P48553 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRAPPC10P48553 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRAPPC10P48553 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRAPPC10P48553 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRAPPC10P48553 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRAPPC10P48553 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TRAPPC10P48553 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRAPPC10P48553 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRAPPC10P48553 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRAPPC10P48553 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRAPPC10P48553 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRAPPC10P48553 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRAPPC10P48553 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRAPPC10P48553 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRAPPC10P48553 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRAPPC10P48553 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRAPPC10P48553 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRAPPC10P48553 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRAPPC10P48553 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRAPPC10P48553 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRAPPC10P48553 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRAPPC10P48553 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRAPPC10P48553 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRAPPC10P48553 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TRAPPC10P48553 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRAPPC10P48553 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRAPPC10P48553 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TRAPPC10P48553 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRAPPC10P48553 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRAPPC10P48553 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRAPPC10P48553 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRAPPC10P48553 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRAPPC10P48553 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRAPPC10P48553 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRAPPC10P48553 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRAPPC10P48553 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRAPPC10P48553 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRAPPC10P48553 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRAPPC10P48553 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRAPPC10P48553 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRAPPC10P48553 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRAPPC10P48553 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRAPPC10P48553 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRAPPC10P48553 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TRAPPC10P48553 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TRAPPC10P48553 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TRAPPC10P48553 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TRAPPC10P48553 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRAPPC10P48553 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRAPPC10P48553 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRAPPC10P48553 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRAPPC10P48553 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRAPPC10P48553 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRAPPC10P48553 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRAPPC10P48553 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRAPPC10P48553 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRAPPC10P48553 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRAPPC10P48553 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRAPPC10P48553 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TRAPPC10P48553 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRAPPC10P48553 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRAPPC10P48553 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRAPPC10P48553 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRAPPC10P48553 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TRAPPC10P48553 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRAPPC10P48553 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRAPPC10P48553 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRAPPC10P48553 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TRAPPC10P48553 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRAPPC10P48553 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRAPPC10P48553 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
TRAPPC10P48553 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRAPPC10P48553 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRAPPC10P48553 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRAPPC10P48553 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRAPPC10P48553 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRAPPC10P48553 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRAPPC10P48553 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRAPPC10P48553 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAPPC10P48553 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAPPC10P48553 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAPPC10P48553 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAPPC10P48553 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAPPC10P48553 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAPPC10P48553 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAPPC10P48553 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms