Protein–RNA interactions for Protein: P40509

SEC28, Coatomer subunit epsilon, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SEC28P40509 YIL171W-AYIL171W-A 453 nt4.4□□□□□ -1.71
SEC28P40509 YJL220WYJL220W 453 nt4.4□□□□□ -1.71
SEC28P40509 ERD2YBL040C 660 nt4.4□□□□□ -1.71
SEC28P40509 RGS2YOR107W 930 nt4.4□□□□□ -1.71
SEC28P40509 ECM23YPL021W 564 nt4.4□□□□□ -1.71
SEC28P40509 OAZ1YPL052W 879 nt4.4□□□□□ -1.71
SEC28P40509 YHL012WYHL012W 1482 nt4.4□□□□□ -1.71
SEC28P40509 YSH1YLR277C 2340 nt4.4□□□□□ -1.71
SEC28P40509 CUS1YMR240C 1311 nt4.4□□□□□ -1.71
SEC28P40509 TGL1YKL140W 1647 nt4.39□□□□□ -1.71
SEC28P40509 RPP1AYDL081C 321 nt4.39□□□□□ -1.71
SEC28P40509 BUD30YDL151C 582 nt4.39□□□□□ -1.71
SEC28P40509 LYS5YGL154C 819 nt4.39□□□□□ -1.71
SEC28P40509 YIL086CYIL086C 309 nt4.39□□□□□ -1.71
SEC28P40509 MNN11YJL183W 1269 nt4.39□□□□□ -1.71
SEC28P40509 CPR6YLR216C 1116 nt4.39□□□□□ -1.71
SEC28P40509 IDI1YPL117C 867 nt4.39□□□□□ -1.71
SEC28P40509 RTK1YDL025C 1863 nt4.39□□□□□ -1.71
SEC28P40509 MSN4YKL062W 1893 nt4.39□□□□□ -1.71
SEC28P40509 YJR012CYJR012C 624 nt4.38□□□□□ -1.71
SEC28P40509 PIR3YKL163W 978 nt4.38□□□□□ -1.71
SEC28P40509 SUI3YPL237W 858 nt4.38□□□□□ -1.71
SEC28P40509 YAR1YPL239W 603 nt4.38□□□□□ -1.71
SEC28P40509 REI1YBR267W 1182 nt4.38□□□□□ -1.71
SEC28P40509 MCP2YLR253W 1710 nt4.38□□□□□ -1.71
SEC28P40509 APP1YNL094W 1764 nt4.37□□□□□ -1.71
SEC28P40509 RRN11YML043C 1524 nt4.37□□□□□ -1.71
SEC28P40509 YMR221CYMR221C 1515 nt4.37□□□□□ -1.71
SEC28P40509 HSP31YDR533C 714 nt4.37□□□□□ -1.71
SEC28P40509 YEL053W-AYEL053W-A 348 nt4.37□□□□□ -1.71
SEC28P40509 ARD1YHR013C 717 nt4.37□□□□□ -1.71
SEC28P40509 WSS1YHR134W 810 nt4.37□□□□□ -1.71
SEC28P40509 SWC7YLR385C 399 nt4.37□□□□□ -1.71
SEC28P40509 PEX12YMR026C 1200 nt4.37□□□□□ -1.71
SEC28P40509 YNR042WYNR042W 429 nt4.37□□□□□ -1.71
SEC28P40509 YMR111CYMR111C 1389 nt4.37□□□□□ -1.71
SEC28P40509 TYR1YBR166C 1359 nt4.37□□□□□ -1.71
SEC28P40509 NUP133YKR082W 3474 nt4.37□□□□□ -1.71
SEC28P40509 GLO3YER122C 1482 nt4.37□□□□□ -1.71
SEC28P40509 MET12YPL023C 1974 nt4.36□□□□□ -1.71
SEC28P40509 snR57snR57 88 nt4.36□□□□□ -1.71
SEC28P40509 RAI1YGL246C 1164 nt4.36□□□□□ -1.71
SEC28P40509 TTI2YJR136C 1266 nt4.36□□□□□ -1.71
SEC28P40509 SPC3YLR066W 555 nt4.36□□□□□ -1.71
SEC28P40509 YMR010WYMR010W 1218 nt4.36□□□□□ -1.71
SEC28P40509 URE2YNL229C 1065 nt4.36□□□□□ -1.71
SEC28P40509 YGK3YOL128C 1128 nt4.36□□□□□ -1.71
SEC28P40509 REG2YBR050C 1017 nt4.36□□□□□ -1.71
SEC28P40509 RDH54YBR073W 2877 nt4.36□□□□□ -1.71
SEC28P40509 FAA1YOR317W 2103 nt4.36□□□□□ -1.71
SEC28P40509 PRD1YCL057W 2139 nt4.36□□□□□ -1.71
SEC28P40509 HCM1YCR065W 1695 nt4.35□□□□□ -1.71
SEC28P40509 SSH4YKL124W 1740 nt4.35□□□□□ -1.71
SEC28P40509 RPL8AYHL033C 771 nt4.35□□□□□ -1.71
SEC28P40509 CPR3YML078W 549 nt4.35□□□□□ -1.71
SEC28P40509 RCL1YOL010W 1104 nt4.35□□□□□ -1.71
SEC28P40509 YOL050CYOL050C 321 nt4.35□□□□□ -1.71
SEC28P40509 WRS1YOL097C 1299 nt4.35□□□□□ -1.71
SEC28P40509 SPO19YPL130W 672 nt4.35□□□□□ -1.71
SEC28P40509 YPR071WYPR071W 636 nt4.35□□□□□ -1.71
SEC28P40509 SHE3YBR130C 1278 nt4.35□□□□□ -1.71
SEC28P40509 YLR345WYLR345W 1530 nt4.35□□□□□ -1.71
SEC28P40509 HMG1YML075C 3165 nt4.35□□□□□ -1.71
SEC28P40509 HOS3YPL116W 2094 nt4.34□□□□□ -1.71
SEC28P40509 KAP114YGL241W 3015 nt4.34□□□□□ -1.71
SEC28P40509 MAF1YDR005C 1188 nt4.34□□□□□ -1.71
SEC28P40509 YGL132WYGL132W 336 nt4.34□□□□□ -1.71
SEC28P40509 BUD13YGL174W 801 nt4.34□□□□□ -1.71
SEC28P40509 COS12YGL263W 1143 nt4.34□□□□□ -1.71
SEC28P40509 YAR030CYAR030C 342 nt4.34□□□□□ -1.71
SEC28P40509 NKP2YLR315W 462 nt4.34□□□□□ -1.71
SEC28P40509 PCL1YNL289W 840 nt4.34□□□□□ -1.71
SEC28P40509 TDA6YPR157W 1404 nt4.34□□□□□ -1.71
SEC28P40509 VBA2YBR293W 1425 nt4.34□□□□□ -1.71
SEC28P40509 FDC1YDR539W 1512 nt4.34□□□□□ -1.71
SEC28P40509 MDM38YOL027C 1722 nt4.33□□□□□ -1.72
SEC28P40509 OLE1YGL055W 1533 nt4.33□□□□□ -1.72
SEC28P40509 YCR075W-AYCR075W-A 228 nt4.33□□□□□ -1.72
SEC28P40509 YCR101CYCR101C 549 nt4.33□□□□□ -1.72
SEC28P40509 TAF10YDR167W 621 nt4.33□□□□□ -1.72
SEC28P40509 SPI1YER150W 447 nt4.33□□□□□ -1.72
SEC28P40509 COX4YGL187C 468 nt4.33□□□□□ -1.72
SEC28P40509 SFH5YJL145W 885 nt4.33□□□□□ -1.72
SEC28P40509 CDC42YLR229C 576 nt4.33□□□□□ -1.72
SEC28P40509 MAP1YLR244C 1164 nt4.33□□□□□ -1.72
SEC28P40509 YPL071CYPL071C 471 nt4.33□□□□□ -1.72
SEC28P40509 YDC1YPL087W 954 nt4.33□□□□□ -1.72
SEC28P40509 SUA7YPR086W 1038 nt4.33□□□□□ -1.72
SEC28P40509 RAD54YGL163C 2697 nt4.32□□□□□ -1.72
SEC28P40509 YIL001WYIL001W 1542 nt4.32□□□□□ -1.72
SEC28P40509 YIL014C-AYIL014C-A 315 nt4.32□□□□□ -1.72
SEC28P40509 tX(XXX)DtX(XXX)D 100 nt4.32□□□□□ -1.72
SEC28P40509 AAD10YJR155W 867 nt4.32□□□□□ -1.72
SEC28P40509 VPS21YOR089C 633 nt4.32□□□□□ -1.72
SEC28P40509 DPH6YLR143W 2058 nt4.32□□□□□ -1.72
SEC28P40509 OSH2YDL019C 3852 nt4.32□□□□□ -1.72
SEC28P40509 SIP1YDR422C 2448 nt4.32□□□□□ -1.72
SEC28P40509 HPR1YDR138W 2259 nt4.32□□□□□ -1.72
SEC28P40509 SPS2YDR522C 1509 nt4.31□□□□□ -1.72
SEC28P40509 RNA14YMR061W 2034 nt4.31□□□□□ -1.72
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