Protein–RNA interactions for Protein: P35125

USP6, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6P35125 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
USP6P35125 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
USP6P35125 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
USP6P35125 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
USP6P35125 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
USP6P35125 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
USP6P35125 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
USP6P35125 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC30.37■■■□□ 2.45
USP6P35125 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
USP6P35125 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC30.37■■■□□ 2.45
USP6P35125 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
USP6P35125 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
USP6P35125 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
USP6P35125 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
USP6P35125 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
USP6P35125 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
USP6P35125 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
USP6P35125 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
USP6P35125 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
USP6P35125 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC30.36■■■□□ 2.45
USP6P35125 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
USP6P35125 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
USP6P35125 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
USP6P35125 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
USP6P35125 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
USP6P35125 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
USP6P35125 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
USP6P35125 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
USP6P35125 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
USP6P35125 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
USP6P35125 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
USP6P35125 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
USP6P35125 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
USP6P35125 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
USP6P35125 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
USP6P35125 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
USP6P35125 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC30.34■■■□□ 2.45
USP6P35125 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
USP6P35125 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
USP6P35125 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
USP6P35125 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
USP6P35125 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
USP6P35125 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
USP6P35125 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
USP6P35125 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
USP6P35125 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
USP6P35125 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
USP6P35125 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC30.33■■■□□ 2.45
USP6P35125 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
USP6P35125 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
USP6P35125 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
USP6P35125 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
USP6P35125 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
USP6P35125 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
USP6P35125 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
USP6P35125 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
USP6P35125 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
USP6P35125 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
USP6P35125 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
USP6P35125 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
USP6P35125 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
USP6P35125 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
USP6P35125 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
USP6P35125 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
USP6P35125 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
USP6P35125 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
USP6P35125 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
USP6P35125 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
USP6P35125 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
USP6P35125 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
USP6P35125 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
USP6P35125 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
USP6P35125 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
USP6P35125 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
USP6P35125 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
USP6P35125 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
USP6P35125 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
USP6P35125 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
USP6P35125 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC30.29■■■□□ 2.44
USP6P35125 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
USP6P35125 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
USP6P35125 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
USP6P35125 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
USP6P35125 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC30.28■■■□□ 2.44
USP6P35125 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
USP6P35125 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
USP6P35125 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
USP6P35125 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
USP6P35125 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
USP6P35125 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
USP6P35125 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
USP6P35125 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC30.27■■■□□ 2.44
USP6P35125 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
USP6P35125 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
USP6P35125 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
USP6P35125 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
USP6P35125 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
USP6P35125 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
USP6P35125 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
USP6P35125 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 182.9 ms