Protein–RNA interactions for Protein: P05090

APOD, Apolipoprotein D, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APODP05090 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
APODP05090 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
APODP05090 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
APODP05090 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
APODP05090 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
APODP05090 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
APODP05090 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APODP05090 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APODP05090 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
APODP05090 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APODP05090 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APODP05090 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APODP05090 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APODP05090 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APODP05090 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APODP05090 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APODP05090 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APODP05090 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APODP05090 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APODP05090 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APODP05090 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APODP05090 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APODP05090 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APODP05090 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APODP05090 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APODP05090 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APODP05090 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
APODP05090 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APODP05090 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APODP05090 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
APODP05090 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APODP05090 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APODP05090 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APODP05090 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APODP05090 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APODP05090 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
APODP05090 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APODP05090 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
APODP05090 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
APODP05090 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
APODP05090 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
APODP05090 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
APODP05090 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
APODP05090 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APODP05090 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APODP05090 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APODP05090 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APODP05090 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APODP05090 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
APODP05090 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
APODP05090 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APODP05090 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APODP05090 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APODP05090 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APODP05090 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
APODP05090 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
APODP05090 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
APODP05090 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
APODP05090 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APODP05090 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
APODP05090 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
APODP05090 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
APODP05090 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APODP05090 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APODP05090 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APODP05090 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APODP05090 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APODP05090 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APODP05090 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APODP05090 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APODP05090 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APODP05090 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APODP05090 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APODP05090 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APODP05090 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APODP05090 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APODP05090 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APODP05090 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
APODP05090 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APODP05090 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
APODP05090 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
APODP05090 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
APODP05090 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
APODP05090 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APODP05090 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
APODP05090 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APODP05090 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APODP05090 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APODP05090 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
APODP05090 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APODP05090 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
APODP05090 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.19
APODP05090 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APODP05090 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APODP05090 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APODP05090 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APODP05090 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APODP05090 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APODP05090 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APODP05090 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms