Protein–RNA interactions for Protein: O43815

STRN, Striatin, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRNO43815 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
STRNO43815 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
STRNO43815 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
STRNO43815 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
STRNO43815 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
STRNO43815 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
STRNO43815 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
STRNO43815 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
STRNO43815 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
STRNO43815 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
STRNO43815 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
STRNO43815 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
STRNO43815 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
STRNO43815 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
STRNO43815 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
STRNO43815 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
STRNO43815 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
STRNO43815 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
STRNO43815 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
STRNO43815 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
STRNO43815 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
STRNO43815 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
STRNO43815 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
STRNO43815 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
STRNO43815 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
STRNO43815 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
STRNO43815 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
STRNO43815 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
STRNO43815 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
STRNO43815 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
STRNO43815 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
STRNO43815 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
STRNO43815 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
STRNO43815 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
STRNO43815 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
STRNO43815 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
STRNO43815 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
STRNO43815 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
STRNO43815 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
STRNO43815 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
STRNO43815 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
STRNO43815 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
STRNO43815 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
STRNO43815 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
STRNO43815 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
STRNO43815 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
STRNO43815 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
STRNO43815 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
STRNO43815 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
STRNO43815 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
STRNO43815 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
STRNO43815 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
STRNO43815 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
STRNO43815 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
STRNO43815 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
STRNO43815 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
STRNO43815 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
STRNO43815 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
STRNO43815 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
STRNO43815 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
STRNO43815 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
STRNO43815 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
STRNO43815 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
STRNO43815 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
STRNO43815 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
STRNO43815 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
STRNO43815 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
STRNO43815 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
STRNO43815 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
STRNO43815 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
STRNO43815 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
STRNO43815 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
STRNO43815 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
STRNO43815 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
STRNO43815 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
STRNO43815 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
STRNO43815 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
STRNO43815 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
STRNO43815 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
STRNO43815 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
STRNO43815 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
STRNO43815 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
STRNO43815 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
STRNO43815 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
STRNO43815 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
STRNO43815 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
STRNO43815 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
STRNO43815 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
STRNO43815 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
STRNO43815 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
STRNO43815 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
STRNO43815 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
STRNO43815 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
STRNO43815 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
STRNO43815 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
STRNO43815 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
STRNO43815 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
STRNO43815 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
STRNO43815 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
STRNO43815 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms