Protein–RNA interactions for Protein: A6NCN2

KRT87P, Putative keratin-87 protein, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT87PA6NCN2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KRT87PA6NCN2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KRT87PA6NCN2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KRT87PA6NCN2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KRT87PA6NCN2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KRT87PA6NCN2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRT87PA6NCN2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
KRT87PA6NCN2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRT87PA6NCN2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRT87PA6NCN2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRT87PA6NCN2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRT87PA6NCN2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRT87PA6NCN2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRT87PA6NCN2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRT87PA6NCN2 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KRT87PA6NCN2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KRT87PA6NCN2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KRT87PA6NCN2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KRT87PA6NCN2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KRT87PA6NCN2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
KRT87PA6NCN2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KRT87PA6NCN2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KRT87PA6NCN2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
KRT87PA6NCN2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KRT87PA6NCN2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KRT87PA6NCN2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KRT87PA6NCN2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KRT87PA6NCN2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KRT87PA6NCN2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KRT87PA6NCN2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRT87PA6NCN2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRT87PA6NCN2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRT87PA6NCN2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRT87PA6NCN2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRT87PA6NCN2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRT87PA6NCN2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
KRT87PA6NCN2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRT87PA6NCN2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRT87PA6NCN2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRT87PA6NCN2 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRT87PA6NCN2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRT87PA6NCN2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRT87PA6NCN2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRT87PA6NCN2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRT87PA6NCN2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRT87PA6NCN2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRT87PA6NCN2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRT87PA6NCN2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRT87PA6NCN2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRT87PA6NCN2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRT87PA6NCN2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRT87PA6NCN2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRT87PA6NCN2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRT87PA6NCN2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRT87PA6NCN2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRT87PA6NCN2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRT87PA6NCN2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRT87PA6NCN2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
KRT87PA6NCN2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
KRT87PA6NCN2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRT87PA6NCN2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRT87PA6NCN2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRT87PA6NCN2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
KRT87PA6NCN2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRT87PA6NCN2 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRT87PA6NCN2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRT87PA6NCN2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRT87PA6NCN2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRT87PA6NCN2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
KRT87PA6NCN2 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRT87PA6NCN2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRT87PA6NCN2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRT87PA6NCN2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRT87PA6NCN2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRT87PA6NCN2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRT87PA6NCN2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRT87PA6NCN2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRT87PA6NCN2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRT87PA6NCN2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRT87PA6NCN2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRT87PA6NCN2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRT87PA6NCN2 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRT87PA6NCN2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRT87PA6NCN2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRT87PA6NCN2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRT87PA6NCN2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRT87PA6NCN2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRT87PA6NCN2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRT87PA6NCN2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRT87PA6NCN2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRT87PA6NCN2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
KRT87PA6NCN2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
KRT87PA6NCN2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
KRT87PA6NCN2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRT87PA6NCN2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRT87PA6NCN2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRT87PA6NCN2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRT87PA6NCN2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRT87PA6NCN2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRT87PA6NCN2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms