Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2V7

COG6, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG6Q9Y2V7 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
COG6Q9Y2V7 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
COG6Q9Y2V7 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
COG6Q9Y2V7 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
COG6Q9Y2V7 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
COG6Q9Y2V7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
COG6Q9Y2V7 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
COG6Q9Y2V7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
COG6Q9Y2V7 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
COG6Q9Y2V7 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
COG6Q9Y2V7 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
COG6Q9Y2V7 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
COG6Q9Y2V7 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
COG6Q9Y2V7 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
COG6Q9Y2V7 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
COG6Q9Y2V7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
COG6Q9Y2V7 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
COG6Q9Y2V7 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
COG6Q9Y2V7 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
COG6Q9Y2V7 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
COG6Q9Y2V7 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
COG6Q9Y2V7 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
COG6Q9Y2V7 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
COG6Q9Y2V7 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
COG6Q9Y2V7 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
COG6Q9Y2V7 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
COG6Q9Y2V7 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
COG6Q9Y2V7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
COG6Q9Y2V7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
COG6Q9Y2V7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
COG6Q9Y2V7 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
COG6Q9Y2V7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
COG6Q9Y2V7 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
COG6Q9Y2V7 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
COG6Q9Y2V7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
COG6Q9Y2V7 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
COG6Q9Y2V7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
COG6Q9Y2V7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
COG6Q9Y2V7 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
COG6Q9Y2V7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
COG6Q9Y2V7 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
COG6Q9Y2V7 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
COG6Q9Y2V7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
COG6Q9Y2V7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
COG6Q9Y2V7 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
COG6Q9Y2V7 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
COG6Q9Y2V7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
COG6Q9Y2V7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
COG6Q9Y2V7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
COG6Q9Y2V7 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
COG6Q9Y2V7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
COG6Q9Y2V7 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
COG6Q9Y2V7 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
COG6Q9Y2V7 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
COG6Q9Y2V7 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
COG6Q9Y2V7 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
COG6Q9Y2V7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
COG6Q9Y2V7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
COG6Q9Y2V7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
COG6Q9Y2V7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
COG6Q9Y2V7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
COG6Q9Y2V7 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
COG6Q9Y2V7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
COG6Q9Y2V7 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
COG6Q9Y2V7 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
COG6Q9Y2V7 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
COG6Q9Y2V7 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
COG6Q9Y2V7 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
COG6Q9Y2V7 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
COG6Q9Y2V7 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
COG6Q9Y2V7 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
COG6Q9Y2V7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
COG6Q9Y2V7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
COG6Q9Y2V7 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
COG6Q9Y2V7 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
COG6Q9Y2V7 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
COG6Q9Y2V7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
COG6Q9Y2V7 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
COG6Q9Y2V7 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
COG6Q9Y2V7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
COG6Q9Y2V7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
COG6Q9Y2V7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
COG6Q9Y2V7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
COG6Q9Y2V7 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
COG6Q9Y2V7 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
COG6Q9Y2V7 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
COG6Q9Y2V7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
COG6Q9Y2V7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
COG6Q9Y2V7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
COG6Q9Y2V7 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
COG6Q9Y2V7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.1
COG6Q9Y2V7 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
COG6Q9Y2V7 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
COG6Q9Y2V7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
COG6Q9Y2V7 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
COG6Q9Y2V7 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
COG6Q9Y2V7 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
COG6Q9Y2V7 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
COG6Q9Y2V7 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
COG6Q9Y2V7 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms